وختم هو وحدة بيثون أن يوفر محاذاة تسلسل على Hadoop.ختم هو من مابريديوس طلب محاذاة تسلسل البيولوجية. أنه يعمل على Hadoop (http://hadoop.apache.org) من خلال Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net)، وهو API بيثون مابريديوس وHDFS لHadoop المتطلبات:. ...
وavalanchetoolbox هي الأدوات لتحديد ووصف عمليات المتفرعة، مثل الانهيارات العصبية المتطلبات:. ...
Murka هو، عبر منصة حرة ومفتوحة المصدر برمجيات سطر الأوامر التي تساعد المستخدمين على حل هذه المشكلة بسهولة نسالة، ببساطة عن طريق استخدام شبكات المتوسط. وهي تشمل أساليب الكشف عن مجريات الأمور، والخوارزميات الدقيقة، فضلا عن مشكلة حلالا شتاينر.ويقدم الصورة إدخال عكسها وstepmatrix المحاذاة، والعروض الإخراج (الفرعية) أشجار...
وHTSeq هو إطار بيثون لمعالجة وتحليل البيانات من الإنتاجية العالية التسلسل (HTS) المقايسات المتطلبات:. ...
والبرتقالي والمعلوماتية الحيوية هو أورانج حزمة برامج استخراج البيانات إضافة على & nbsp؛ يمكنك فهي تمتد البرتقال من خلال توفير الوظائف المشتركة للمهام الأساسية في المعلوماتية الحيوية. كما يوفر الحاجيات لأورانج قماش، والتي تتيح للمستخدمين الذين ليسوا مبرمجين لإدارة ميكروأري والبيانات الجينومية التدفق وتخصيص تحليلهم عن...
وedittag هو جمع تطبيق لتصميم مجموعات من تعديل العلامات تسلسل متري، والتحقق من علامات تسلسل التشكل لتحرير متري، ودمج علامات تسلسل لمحولات التسلسل منصة محددة والاشعال PCR. edittag يختلف عن المناهج الأخرى:ونبسب؛ * edittag يولد أطوال التعسفية من الأكواد تسلسل تحرير المتري في أطر زمنية معقولة باستخدام المعالجة...
يوفر ومشروع فولكان الحسابية تحليل ديناميات السوائل.VULCAN (اللزجة عكس الريح خوارزمية لمجمع تحليل التدفق) تقدم ديناميات السوائل الحسابية للسرعة دون سرعة الصوت من خلال مضطربة تفوق سرعتها سرعة الصوت التفاعل والتدفقات غير رد فعل على مجموعة متنوعة من المنصات الحاسوبية التسلسلية والمتوازية.يتم تقليل تكلفة الحسابية للتحليل...
وseriesoftubes هو خط أنابيب ممتدة لSolexa البيانات الشذرة وما يليها.حزمة الوثائق والمتطلبات:...
وreciprocal_smallest_distance هو خوارزمية orthology البشرى يستخدم محاذاة تسلسل العالمية والحد الأقصى احتمال المسافة التطورية بين متواليات ليكشف بدقة orthologs بين الجينوم.تثبيت من كتل القطرانتحميل وuntar أحدث نسخة من جيثب:مؤتمر نزع السلاح ~-L حليقة...
وبناء نظم مثل جعل كثير من الأحيان يتم استخدامها لإنشاء سير العمل المعقدة، على سبيل المثال في المعلوماتية الحيوية على & nbsp؛ وتهدف snakemake للحد من تعقيد خلق سير العمل من خلال توفير مجال اللغة نظيفة وحديثة محددة المواصفات (DSL) في الاسلوب الثعبان، جنبا إلى جنب مع بيئة تنفيذ سريعة ومريحة.تركيب- في أوبونتو 12.04، يمكنك...
