جديد المعلوماتية الحيوية إلى Linux
ومشروع Geant4 هو مجموعة أدوات لمحاكاة مرور الجزيئات من خلال الموضوع.وتشمل مجالات تطبيقه فيزياء الطاقة العالية والتجارب النووية، مسرع وفيزياء الفضاء الدراسات الطبية ما هو الجديد في هذا الإصدار:. نموذج جديد من التفاعلات النووية جاما باستخدام برتيني تمت إضافة تتالي.تم عرض نموذج برتيني لpi-، K-، وسيغما لالتقاط النووي...
وبدأ المشروع STEME الحياة كما تقريب للخوارزمية التوقع-Maximisation لنوع النموذج المستخدم في المكتشفون عزر مثل MEME.STEME و؛ [س] EM تقريب يدير أمر من حجم أسرع من تنفيذ MEME لإعدادات المعلمة النموذجية. وقد وضعت STEME الآن إلى مكتشف عزر كامل العضوية في حد ذاتها.لماذا استخدام STEME؟تقنيات النتيجة عزر ثبتويستند STEME على...
وGenepidgin هو مجموعة من الأدوات التي تساعد في بيثون تقييم وتعيين جين أسماء المنتجات على & nbsp؛ هناك ثلاثة عناصر أساسية:genepidgin * أنظف *على & nbsp؛ توحد أسماء الجين في المبادئ التوجيهية تسمية UNIPROTgenepidgin * مقارنة *على & nbsp؛ يقارن مجموعتين أو أكثر من أسماء الجينgenepidgin * حدد *على & nbsp؛ يختار اسم المنتج...
وقفيصة هي عبارة عن منصة شاملة مفتوحة المصدر والذي يدمج خط أنابيب الحسابية عالية الأداء لتحديد تسلسل الممرض & nbsp؛ و توصيف في الجينومات البشرية وtranscriptomes جنبا إلى جنب مع قاعدة بيانات النتائج قابلة للوعلى شبكة الإنترنت تطبيق البرمجيات سهلة الاستخدام لإدارة، الاستعلام عن وتصور النتائج.ابدءسوف تحتاج إلى قاعدة...
وMISO (خليط من الأشكال الإسوية) هو إطار احتمالي مكتوبة في بيثون أن quantitates مستوى التعبير على & nbsp؛ من الجينات تقسم بدلا من البيانات RNA يليها، ويحدد الأشكال الإسوية المنظمة تفاضلي أو الإكسونات عبر العينات.عبر الاقتداء عملية توليدي التي يتم إنتاجها من الأشكال الإسوية في RNA تسلسل يقرأ، يستخدم نموذج MISO الاستدلال...
وMACS2 هو أداة تحليل نموذج يستند للبيانات ذات رقاقة وما يليها.مع تحسن تقنيات التسلسل، وجاء الكروماتين مناعي التي كتبها عالية الإنتاجية تسلسل (رقاقة تسلسل) تزداد شعبية لدراسة التفاعلات-DNA البروتين على نطاق الجينوم. لمعالجة نقص قوي أسلوب التحليل رقاقة وما يليها، نقدم خوارزمية جديدة، واسمه التحليل الذي يعتمد الموديل من...
وbiotools هو مجموعة من المرافق المعلوماتية الحيوية مكتوبة في بيثون المتطلبات:. ...
وPathVisio هو مفتوح المصدر وتطبيق رسومية خالية تماما تنفيذها في لغة البرمجة جافا والمصممة من الألف إلى الياء ليتم استخدامها لعرض وتحليل وتحرير المسارات البيولوجية تحت التشغيل جنو / لينكس system.Can أن تستخدم لرسم مسارات ، ربط البرمجيات entitiesThe البيولوجي يتيح للمستخدمين رسم مسارات، ربط الكيانات البيولوجية...
وPathomx (MetaPath سابقا) هو مفتوح المصدر البرمجيات الرسومية تنفيذها في IPython، كيو تي وبيكت، وقد تم تصميمها من الألف إلى الياء ليكون بمثابة أداة تفاعلية لتصور وتحليل البيانات الأيضية تحت جنو / لينكس وغيرها من POSIX على & nbsp؛ التشغيل الأنظمة. تم تصميم في البداية لاستخدامها لمعالجة الايض data.Features في ملامح...