وبناء نظم مثل جعل كثير من الأحيان يتم استخدامها لإنشاء سير العمل المعقدة، على سبيل المثال في المعلوماتية الحيوية على & nbsp؛ وتهدف snakemake للحد من تعقيد خلق سير العمل من خلال توفير مجال اللغة نظيفة وحديثة محددة المواصفات (DSL) في الاسلوب الثعبان، جنبا إلى جنب مع بيئة تنفيذ سريعة ومريحة.تركيب- في أوبونتو 12.04، يمكنك...
CLC DNA طاولة العمل يخلق بيئة برمجيات تمكن المستخدمين من إجراء عدد كبير من تسلسل الحمض النووي المتقدم تحليلات، جنبا إلى جنب مع إدارة البيانات على نحو سلس، وعرض وخيارات الانتاج رسومية ممتازة.CLC DNA طاولة العمل هو متاح في ويندوز، ماك OS X، ومنصات لينكس الميزات:. يتميز المعلوماتية الحيوية في جين طاولة العمل:مرونة...
وseriesoftubes هو خط أنابيب ممتدة لSolexa البيانات الشذرة وما يليها.حزمة الوثائق والمتطلبات:...
وبدأ المشروع STEME الحياة كما تقريب للخوارزمية التوقع-Maximisation لنوع النموذج المستخدم في المكتشفون عزر مثل MEME.STEME و؛ [س] EM تقريب يدير أمر من حجم أسرع من تنفيذ MEME لإعدادات المعلمة النموذجية. وقد وضعت STEME الآن إلى مكتشف عزر كامل العضوية في حد ذاتها.لماذا استخدام STEME؟تقنيات النتيجة عزر ثبتويستند STEME على...
وGenepidgin هو مجموعة من الأدوات التي تساعد في بيثون تقييم وتعيين جين أسماء المنتجات على & nbsp؛ هناك ثلاثة عناصر أساسية:genepidgin * أنظف *على & nbsp؛ توحد أسماء الجين في المبادئ التوجيهية تسمية UNIPROTgenepidgin * مقارنة *على & nbsp؛ يقارن مجموعتين أو أكثر من أسماء الجينgenepidgin * حدد *على & nbsp؛ يختار اسم المنتج...
وMISO (خليط من الأشكال الإسوية) هو إطار احتمالي مكتوبة في بيثون أن quantitates مستوى التعبير على & nbsp؛ من الجينات تقسم بدلا من البيانات RNA يليها، ويحدد الأشكال الإسوية المنظمة تفاضلي أو الإكسونات عبر العينات.عبر الاقتداء عملية توليدي التي يتم إنتاجها من الأشكال الإسوية في RNA تسلسل يقرأ، يستخدم نموذج MISO الاستدلال...
وPathomx (MetaPath سابقا) هو مفتوح المصدر البرمجيات الرسومية تنفيذها في IPython، كيو تي وبيكت، وقد تم تصميمها من الألف إلى الياء ليكون بمثابة أداة تفاعلية لتصور وتحليل البيانات الأيضية تحت جنو / لينكس وغيرها من POSIX على & nbsp؛ التشغيل الأنظمة. تم تصميم في البداية لاستخدامها لمعالجة الايض data.Features في ملامح...
والجحور-ويلر أليجنر (BWA) هو برنامج فعال التي تؤيد تسلسل النوكليوتيدات قصيرة نسبيا ضد تسلسل إشارة طويلة مثل الجينوم البشري.البرنامج ينفذ اثنين من الخوارزميات،-BWA القصير وBWA-SW. الأعمال السابقة للاستعلام تتابعات أقصر من 200bp والثاني لمتواليات أطول تصل إلى حوالي 100kbp.كلا خوارزميات تفعل محاذاة شق. وهي عادة ما تكون...
وavalanchetoolbox هي الأدوات لتحديد ووصف عمليات المتفرعة، مثل الانهيارات العصبية المتطلبات:. ...
وOpenElectrophy هو إطار لتسهيل التلاعب، وتخزين وتحليل البيانات الكهربية. يمكن استيراد البيانات من العديد من تنسيقات الملفات المختلفة وتخزينها في قاعدة بيانات SQL من نوع واحد.أدوات التحليل المدرجة في OpenELectrophy هي الكشف عن التذبذب وارتفاع الكشف. المزيد من التحليل يجب أن تكون مكتوبة ولكنها توفر OpenElectrophy مكتبة...
