أفضل المعلوماتية الحيوية إلى Linux

NetAtlas هو البرنامج المساعد Cytoscape التي تستخدم الأنسجة بيانات التعبير الجيني لتصفية شبكة الإشارات الخلوية. يحدد NetAtlas شبكات المعرفة من قبل الأنسجة، مكونات شبكة الأنسجة محددة، والمكونات مع التعبير مترابط عبر...

CLC تسلسل المشاهد يخلق بيئة برمجيات تمكن المستخدمين من إجراء المعلوماتية الحيوية الأساسية تحليل وإدارة البيانات على نحو سلس، جنبا إلى جنب مع عرض وخيارات الانتاج رسومية ممتازة.وهنا بعض الملامح الرئيسية "CLC الحرة طاولة العمل":- بنك الجينات البحث وعرض (خطي وجهات النظر التعميم)- تشكيلة متعددة من DNA، RNA والبروتينات (2...

وختم هو وحدة بيثون أن يوفر محاذاة تسلسل على Hadoop.ختم هو من مابريديوس طلب محاذاة تسلسل البيولوجية. أنه يعمل على Hadoop (http://hadoop.apache.org) من خلال Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net)، وهو API بيثون مابريديوس وHDFS لHadoop المتطلبات:. ...

وbiotools هو مجموعة من المرافق المعلوماتية الحيوية مكتوبة في بيثون المتطلبات:. ...

وPysam هو وحدة بيثون للقراءة والتلاعب Samfiles & nbsp؛ يمكنك انها المجمع خفيفة الوزن من samtools C-API.دليل البدء السريع هو هنا. وثائق أكثر تفصيلا متاحة هنا.الأسئلة والتعليقات هي موضع ترحيب للغاية وينبغي أن ترسل إلى مجموعة المستخدمين pysam في http://groups.google.com/group/pysam-user-groupWhat هو الجديد في هذا...

وHTSeq هو إطار بيثون لمعالجة وتحليل البيانات من الإنتاجية العالية التسلسل (HTS) المقايسات المتطلبات:. ...

checkmyclones هي البرامج التي توفر أدوات للتحقق سانجر نتائج التسلسل على & nbsp؛. (أو أي نص عادي أو ملفات FASTQ) ضد مجموعة من متواليات إشارة، المنصوص عليها في أي شكل معقول (بما في ذلك الإحداثيات) المتطلبات: ...

RFLP مخطط هو الأداة التي تساعد على تخطيط تجربة RFLP: إنه يجد الانزيمات التقييد الذي قطع مجموعة من تسلسل الحمض النووي نديد بطرق مختلفة ويحاكي الناجمة الصورة الكهربائي gel-. برنامج يساعدك على العثور على أنزيمات التقييد الحاسمة التي تميز السكان. مع محاكاة الكهربائي فمن السهل أن اختار الانزيمات التقييد التي تظهر أفضل...

CodonW هو برنامج مصمم لتبسيط التحليل متعدد المتغيرات (تحليل المراسلات) من استخدام كودون والأحماض الأمينية. كما تحسب المؤشرات القياسية للاستخدام كودون. انها على حد سواء القائمة واجهة سطر الأوامر.كتب المشروع CodonW التي كتبها جون بيدن في مختبر بول شارب، قسم علم الوراثة في جامعة نوتنغهام. ويعمل جون في علم الوراثة البشرية...

مشروع Adun هو برنامج المحاكاة الجزيئية البيولوجية للمد يتضمن قدرات إدارة البيانات وتحليلها.يوفر Adun الخوارزميات والبروتوكولات المتقدمة لمحاكاة الجزيئية التي يمكن الوصول إليها من واجهة مستخدم بديهية ولكن أيضا من المستوى البرنامجي أكثر مرونة. أنها بنيت على الإطار Adun التي هي مكتبة قوية لخلق والتلاعب المحاكاة.ومع ذلك...