ProteinShop هو أداة تفاعلية لمعالجة هياكل البروتين. وقد صمم هذا البرنامج بسرعة لخلق مجموعة من التشكيلات البروتين باستخدام المعرفة الإنسانية والحدس. هذه التكوينات يمكن أن تخضع لتحسين المحلي أو العالمي. على الرغم من أن ProteinShopلا يتم تنفيذ عملية التحسين العالمية نفسها، فإنه يوفرالإطار التي يمكن استخدامها للتفاعل مع...
pyNetConv هي مكتبة بايثون التي أنشئت لمساعدة تحويل بعض تنسيقات الملفات الشبكة.منذ الإصدار 0.6، pyNetConv قادر على القراءة / الكتابة (وتحويل من / إلى) تنسيقات الملفات...
وPysam هو وحدة بيثون للقراءة والتلاعب Samfiles & nbsp؛ يمكنك انها المجمع خفيفة الوزن من samtools C-API.دليل البدء السريع هو هنا. وثائق أكثر تفصيلا متاحة هنا.الأسئلة والتعليقات هي موضع ترحيب للغاية وينبغي أن ترسل إلى مجموعة المستخدمين pysam في http://groups.google.com/group/pysam-user-groupWhat هو الجديد في هذا...
وPySCeS هو مشروع وضعته الثلاثي J المجموعة للخلية الجزيئية علم وظائف الأعضاء على & nbsp؛ من أجل محاولة نموذج وفهم العمليات والأنظمة المعقدة التي تشكل الخلية الحية الميزات:. ونص يستند وصف نموذج اللغة.وحدة تحليل الهيكلية.تكامل لمحاكاة الوقتيحلون غير الخطية لتحليل الحالة المستقرةوحدة نمطية لأداء التمثيل الغذائي تحليل...
وreciprocal_smallest_distance هو خوارزمية orthology البشرى يستخدم محاذاة تسلسل العالمية والحد الأقصى احتمال المسافة التطورية بين متواليات ليكشف بدقة orthologs بين الجينوم.تثبيت من كتل القطرانتحميل وuntar أحدث نسخة من جيثب:مؤتمر نزع السلاح ~-L حليقة...
RFLP مخطط هو الأداة التي تساعد على تخطيط تجربة RFLP: إنه يجد الانزيمات التقييد الذي قطع مجموعة من تسلسل الحمض النووي نديد بطرق مختلفة ويحاكي الناجمة الصورة الكهربائي gel-. برنامج يساعدك على العثور على أنزيمات التقييد الحاسمة التي تميز السكان. مع محاكاة الكهربائي فمن السهل أن اختار الانزيمات التقييد التي تظهر أفضل...
وختم هو وحدة بيثون أن يوفر محاذاة تسلسل على Hadoop.ختم هو من مابريديوس طلب محاذاة تسلسل البيولوجية. أنه يعمل على Hadoop (http://hadoop.apache.org) من خلال Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net)، وهو API بيثون مابريديوس وHDFS لHadoop المتطلبات:. ...
وseriesoftubes هو خط أنابيب ممتدة لSolexa البيانات الشذرة وما يليها.حزمة الوثائق والمتطلبات:...
وبناء نظم مثل جعل كثير من الأحيان يتم استخدامها لإنشاء سير العمل المعقدة، على سبيل المثال في المعلوماتية الحيوية على & nbsp؛ وتهدف snakemake للحد من تعقيد خلق سير العمل من خلال توفير مجال اللغة نظيفة وحديثة محددة المواصفات (DSL) في الاسلوب الثعبان، جنبا إلى جنب مع بيئة تنفيذ سريعة ومريحة.تركيب- في أوبونتو 12.04، يمكنك...
وSSuMMo هي مكتبة من الوظائف مصممة حول تكرارا باستخدام hmmer لتعيين متواليات لأصناف & nbsp؛ يمكنك النتائج هي أشجار المشروح للغاية تظهر الأنواع / توزيع جنس داخل هذا المجتمع.البرامج المضمنة مع شفرة المصدر وتشمل الأدوات اللازمة ل: -- بناء قاعدة بيانات هرمية خفية نماذج ماركوف - dictify.py.- تخصيص متواليات لأسماء التصنيفية...
