والقوبيون هو خلق API بيثون لقراءة ملفات البيانات الثنائية باستخدام إطار إدارة البيانات القوبيون المقبل جنرال.عادة، ويأتي هذا الدليل كجزء من حزمة القوبيون كاملة، والمتاحة من:على & nbsp؛ المتشعب: //goby.campagnelab.org/وتتضمن حزمة كاملة شفرة المصدر جافا. إذا قمت بتحميل هذه الحزمة من PyPI أو بعض المصادر بيثون محددة أخرى،...
وHTSeq هو إطار بيثون لمعالجة وتحليل البيانات من الإنتاجية العالية التسلسل (HTS) المقايسات المتطلبات:. ...
Jmol هو برنامج مفتوح المصدر ، ونظام متعدد المنصات ، وبرنامج رسوميات مجاني تم تصميمه في الأصل ليكون بمثابة عارض جزيئي للهياكل الكيميائية ثلاثية الأبعاد. يتم تشغيله بأربعة أوضاع مستقلة ، كتطبيق HTML5 على الويب ، وبرنامج Java ، وبرمجية Java ، ومكون من جانب الخادم "بدون رأس". ينم في لمحة تتضمن الميزات الرئيسية دعمًا...
LSim superposes كثافة الإلكترونات الجزيئات ويحسب على درجة التشابه الهيكلية. الحسابية على نطاق وخطيا مع حجم جزيئات يجري مقارنة.التحالفات LSim لا علاقة لها من الناحية المفاهيمية العناصر الهيكلية الكيمياء الحيوية، وبالتالي هي غير متحيزة والمناسبة للدراسات البروتين تشابه البنية الوحيد.التركيب:فك ملف التوزيع:القطران -xzvf...
MacMolPlt هو برنامج الرسومات الحديثة بتهمة التآمر الهياكل الجزيئية 3-D وسائط العادية (الاهتزازات). الوسائل...
وMACS2 هو أداة تحليل نموذج يستند للبيانات ذات رقاقة وما يليها.مع تحسن تقنيات التسلسل، وجاء الكروماتين مناعي التي كتبها عالية الإنتاجية تسلسل (رقاقة تسلسل) تزداد شعبية لدراسة التفاعلات-DNA البروتين على نطاق الجينوم. لمعالجة نقص قوي أسلوب التحليل رقاقة وما يليها، نقدم خوارزمية جديدة، واسمه التحليل الذي يعتمد الموديل من...
massXpert حزمة مطياف الكتلة هي بيئة مطياف الكتلة لالخطي (الحيوي) البوليمرات. فإنه يرث كل الابتكارات من GNU polyxmass، كما هو المنفذ لهذا المشروع لبيئة التطوير عبر منصة ما هو الجديد في هذا الإصدار:. تحسينات في XpertMiner الوحدة التي تجعل العمل مع القوائم أسهل.ثابت خلل الحساب التي ظهرت عند حساب الكتلة النظائر من...
MetagenomeDB هي مكتبة بايثون مصممة لتخزين بسهولة، واسترداد وتعليم تسلسل metagenomic & nbsp؛ يمكنك MetagenomeDB تكون بمثابة طبقة تجريد فوق قاعدة بيانات MongoDB. أنه يوفر API لإنشاء وتعديل وربط نوعين من الكائنات، وهي سلاسل ومجموعات:على & nbsp؛ * تسلسل (الدرجة تسلسل) يمكن أن يكون يقرأ، contigs، استنساخ PCR، الخعلى &...
وMISO (خليط من الأشكال الإسوية) هو إطار احتمالي مكتوبة في بيثون أن quantitates مستوى التعبير على & nbsp؛ من الجينات تقسم بدلا من البيانات RNA يليها، ويحدد الأشكال الإسوية المنظمة تفاضلي أو الإكسونات عبر العينات.عبر الاقتداء عملية توليدي التي يتم إنتاجها من الأشكال الإسوية في RNA تسلسل يقرأ، يستخدم نموذج MISO الاستدلال...
mpiBLAST هو التنفيذ المتوازي MPI أساس من NCBI BLAST. ويتكون المشروع من زوج من البرامج التي تحل محل formatdb وblastall مع الإصدارات التي تنفذ وظائف انفجار في نفس الوقت على مجموعة من أجهزة الكمبيوتر مع MPI تركيبها. هناك نوعان من المزايا الأساسية لاستخدام mpiBLAST مقابل BLAST التقليدي.أولا، mpiBLAST يقسم قاعدة البيانات...
