شتادين حزمة هو مجموعة كاملة النمو التجمع تسلسل الحمض النووي (Gap4)، والتحرير، وأدوات التحليل (سبين) ليونكس، لينكس، ماكوسكس ويندوز من مايكروسوفت.على الجبهة Gap4 كانت هناك العديد من قاصر انضمامه ذات الصلةتحسينات في كيف عشرات ينضم في إيجاد ينضم الداخلية ووظيفة الزر محاذاة في تاريخ محرر.أيضا نتيجة لgap4 هي التغييرات...
وبدأ المشروع STEME الحياة كما تقريب للخوارزمية التوقع-Maximisation لنوع النموذج المستخدم في المكتشفون عزر مثل MEME.STEME و؛ [س] EM تقريب يدير أمر من حجم أسرع من تنفيذ MEME لإعدادات المعلمة النموذجية. وقد وضعت STEME الآن إلى مكتشف عزر كامل العضوية في حد ذاتها.لماذا استخدام STEME؟تقنيات النتيجة عزر ثبتويستند STEME على...
وSTEPS هو عبارة عن حزمة لمحاكاة مؤشر ستوكاستيك الدقيقة لأنظمة رد فعل نشر في هندستها 3D معقدة بصورة تعسفية. لدينا خوارزمية محاكاة الأساسية هي تنفيذ SSA غيليسبي، وسعت للتعامل مع انتشار الجزيئات على عناصر من شبكة رباعي السطوح 3D.في حين وضعت أساسا لمحاكاة نماذج مفصلة لمسارات الإشارات العصبية في التشعبات وحول نقاط الاشتباك...
Syntainia هو التطبيق المبتكر لرؤية الجينوم متعددة على & nbsp؛ وهو يقدم واجهة مستخدم بسيطة وبديهية لعرض والتلاعب علاقات بين مجموعات من الجينات. مع التصور الجينات أكثر وضوحا، فإنه من السهل على الباحث لتحديد حفظ تصاحب جيني بين الجينوم متعددة. Syntainia هو تطبيق سطح المكتب التي تبدو كبيرة وتدير على نحو سلس على ويندوز،...
SyntenyMiner هو تطبيق لتصور واستجواب مقارنات بين عدة تسلسل الجينوم كاملة. يوفر واجهة وجهة نظر للملاحة من المباريات لتسلسل الجينوم مرجعية. تسلسل مباريات بين الكروموسومات من جينومات مختلفة يمكن مزيد من البحث في سياق مؤامرة نقطة، وكشف عن rearragements الجينوم كبيرها وصغيرها النطاق بما في ذلك ظاهرة الانقلاب، الإدراج /...
التابير هو أداة بايثون الذي يحتوي برامج لتقدير ومؤامرة informativeness النشوء والتطور لمجموعات البيانات الكبيرة.نقلا عن التابيرعند استخدام التابير، يرجى ذكر:- فيركلوث قبل الميلاد، وتشانغ J، الفارو ME: التابير يمكن تحليل إنتاجية عالية من informativeness النشوء والتطور.- تاونسند JP: التنميط informativeness النشوء...
tigreBrowser هو التعبير الجيني متصفح نموذج للحصول على نتائج من حزمة R تيغري (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html).التركيب:يتطلب tigreBrowser بيثون الإصدار> = 2.5. يمكن تركيبها tigreBrowser مع الأمر التالي:بيثون setup.py تثبيتلمزيد من المعلومات حول تثبيت وحدات بيثون (على سبيل المثال،...
وTRMiner هو أداة بايثون الذي يهدف إلى القيمين البيانات العلمية على & nbsp؛. انها تسمح لتقليم بسرعة مجموعات كبيرة من المنشورات العلمية لأحكام ذات الصلة من أجل هدف التعدين معين.ويتحقق هذا في خطوتين. أولا، وtranlated النصوص على شكل سلاسل من رموز للكلمات ذات الصلة. ثانيا، يتم البحث أنماط التعبير العادية في تسلسل رمزية....
يوفر ومشروع فولكان الحسابية تحليل ديناميات السوائل.VULCAN (اللزجة عكس الريح خوارزمية لمجمع تحليل التدفق) تقدم ديناميات السوائل الحسابية للسرعة دون سرعة الصوت من خلال مضطربة تفوق سرعتها سرعة الصوت التفاعل والتدفقات غير رد فعل على مجموعة متنوعة من المنصات الحاسوبية التسلسلية والمتوازية.يتم تقليل تكلفة الحسابية للتحليل...
