وOpenElectrophy هو إطار لتسهيل التلاعب، وتخزين وتحليل البيانات الكهربية. يمكن استيراد البيانات من العديد من تنسيقات الملفات المختلفة وتخزينها في قاعدة بيانات SQL من نوع واحد.أدوات التحليل المدرجة في OpenELectrophy هي الكشف عن التذبذب وارتفاع الكشف. المزيد من التحليل يجب أن تكون مكتوبة ولكنها توفر OpenElectrophy مكتبة...
وPEAT هو مجموعة من البرامج لالتقاط، وتوقع وتحليل الخصائص الفيزيائية الحيوية للبروتينات.انظر http://enzyme.ucd.ie/PEAT للتوثيق والتعليمات، لقطات الخ المتطلبات:. ...
والجحور-ويلر أليجنر (BWA) هو برنامج فعال التي تؤيد تسلسل النوكليوتيدات قصيرة نسبيا ضد تسلسل إشارة طويلة مثل الجينوم البشري.البرنامج ينفذ اثنين من الخوارزميات،-BWA القصير وBWA-SW. الأعمال السابقة للاستعلام تتابعات أقصر من 200bp والثاني لمتواليات أطول تصل إلى حوالي 100kbp.كلا خوارزميات تفعل محاذاة شق. وهي عادة ما تكون...
وSSuMMo هي مكتبة من الوظائف مصممة حول تكرارا باستخدام hmmer لتعيين متواليات لأصناف & nbsp؛ يمكنك النتائج هي أشجار المشروح للغاية تظهر الأنواع / توزيع جنس داخل هذا المجتمع.البرامج المضمنة مع شفرة المصدر وتشمل الأدوات اللازمة ل: -- بناء قاعدة بيانات هرمية خفية نماذج ماركوف - dictify.py.- تخصيص متواليات لأسماء التصنيفية...
والقوبيون هو خلق API بيثون لقراءة ملفات البيانات الثنائية باستخدام إطار إدارة البيانات القوبيون المقبل جنرال.عادة، ويأتي هذا الدليل كجزء من حزمة القوبيون كاملة، والمتاحة من:على & nbsp؛ المتشعب: //goby.campagnelab.org/وتتضمن حزمة كاملة شفرة المصدر جافا. إذا قمت بتحميل هذه الحزمة من PyPI أو بعض المصادر بيثون محددة أخرى،...
وPySCeS هو مشروع وضعته الثلاثي J المجموعة للخلية الجزيئية علم وظائف الأعضاء على & nbsp؛ من أجل محاولة نموذج وفهم العمليات والأنظمة المعقدة التي تشكل الخلية الحية الميزات:. ونص يستند وصف نموذج اللغة.وحدة تحليل الهيكلية.تكامل لمحاكاة الوقتيحلون غير الخطية لتحليل الحالة المستقرةوحدة نمطية لأداء التمثيل الغذائي تحليل...
وPysam هو وحدة بيثون للقراءة والتلاعب Samfiles & nbsp؛ يمكنك انها المجمع خفيفة الوزن من samtools C-API.دليل البدء السريع هو هنا. وثائق أكثر تفصيلا متاحة هنا.الأسئلة والتعليقات هي موضع ترحيب للغاية وينبغي أن ترسل إلى مجموعة المستخدمين pysam في http://groups.google.com/group/pysam-user-groupWhat هو الجديد في هذا...
وTRMiner هو أداة بايثون الذي يهدف إلى القيمين البيانات العلمية على & nbsp؛. انها تسمح لتقليم بسرعة مجموعات كبيرة من المنشورات العلمية لأحكام ذات الصلة من أجل هدف التعدين معين.ويتحقق هذا في خطوتين. أولا، وtranlated النصوص على شكل سلاسل من رموز للكلمات ذات الصلة. ثانيا، يتم البحث أنماط التعبير العادية في تسلسل رمزية....
وختم هو وحدة بيثون أن يوفر محاذاة تسلسل على Hadoop.ختم هو من مابريديوس طلب محاذاة تسلسل البيولوجية. أنه يعمل على Hadoop (http://hadoop.apache.org) من خلال Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net)، وهو API بيثون مابريديوس وHDFS لHadoop المتطلبات:. ...
وavalanchetoolbox هي الأدوات لتحديد ووصف عمليات المتفرعة، مثل الانهيارات العصبية المتطلبات:. ...
