يجب أن يكون المعلوماتية الحيوية إلى Linux
مشروع Adun هو برنامج المحاكاة الجزيئية البيولوجية للمد يتضمن قدرات إدارة البيانات وتحليلها.يوفر Adun الخوارزميات والبروتوكولات المتقدمة لمحاكاة الجزيئية التي يمكن الوصول إليها من واجهة مستخدم بديهية ولكن أيضا من المستوى البرنامجي أكثر مرونة. أنها بنيت على الإطار Adun التي هي مكتبة قوية لخلق والتلاعب المحاكاة.ومع ذلك...
AHREA هو مجموعة sofware أن يجعل من العثور على التعبير النسبي المتعلمين سهلا. هو مكتوب في بيثون المتطلبات:. ...
AREM هو على أساس MACS (التحليل القائم على نموذج للبيانات ذات رقاقة وما يليها).ويستخدم على نطاق واسع عالية الإنتاجية تسلسل بالإضافة إلى هطول الأمطار المناعية لونين (رقاقة تسلسل) في وصف الجينوم على نطاق أنماط ملزمة عوامل النسخ، والعوامل المساعدة، معدلات الكروماتين، وغيرها من البروتينات الحمض النووي ملزم. خطوة رئيسية في...
وavalanchetoolbox هي الأدوات لتحديد ووصف عمليات المتفرعة، مثل الانهيارات العصبية المتطلبات:. ...
والرفاهيه هو LIMS مصغرة ومدير لسير العمل المعلوماتية الحيوية، وكتب في بيثون المتطلبات:. ...
نظام المعيار المعلوماتية الحيوية هو محاولة لبناء إطار معقول الاختبار، والاختبارات، والبيانات، لتمكين المستخدمين النهائيين والموردين للتحقيق في أداء أنظمتها.ما نحاول القيام به هو خلق إطار للاختبار، ومجموعة أساسية من الاختبارات يتمكن الجميع من تحميل واستخدامها لتحقيق عناصر محددة من أداء النظم.وعلاوة على ذلك، هي مصدر...
وbiotools هو مجموعة من المرافق المعلوماتية الحيوية مكتوبة في بيثون المتطلبات:. ...
والجحور-ويلر أليجنر (BWA) هو برنامج فعال التي تؤيد تسلسل النوكليوتيدات قصيرة نسبيا ضد تسلسل إشارة طويلة مثل الجينوم البشري.البرنامج ينفذ اثنين من الخوارزميات،-BWA القصير وBWA-SW. الأعمال السابقة للاستعلام تتابعات أقصر من 200bp والثاني لمتواليات أطول تصل إلى حوالي 100kbp.كلا خوارزميات تفعل محاذاة شق. وهي عادة ما تكون...
وقفيصة هي عبارة عن منصة شاملة مفتوحة المصدر والذي يدمج خط أنابيب الحسابية عالية الأداء لتحديد تسلسل الممرض & nbsp؛ و توصيف في الجينومات البشرية وtranscriptomes جنبا إلى جنب مع قاعدة بيانات النتائج قابلة للوعلى شبكة الإنترنت تطبيق البرمجيات سهلة الاستخدام لإدارة، الاستعلام عن وتصور النتائج.ابدءسوف تحتاج إلى قاعدة...
checkmyclones هي البرامج التي توفر أدوات للتحقق سانجر نتائج التسلسل على & nbsp؛. (أو أي نص عادي أو ملفات FASTQ) ضد مجموعة من متواليات إشارة، المنصوص عليها في أي شكل معقول (بما في ذلك الإحداثيات) المتطلبات: ...