البرمجيات قطة:
تفاصيل البرنامج:
ويوفر الروتينية التحليلية والإحصائية، موزعي لتنسيقات الملفات المشتركة ويسمح للتلاعب من متواليات والهياكل 3D.
BioJava هو أداة لاستكشاف إمكانيات جافا في العالم المعلوماتية الحيوية
ما هو جديد في هذا الإصدار:.
- وتسجيل الخطأ واتساقا. يستخدم SLF4J لقطع الأشجار وتوفر محولات لجميع تطبيقات تسجيل الكبرى.
- وتحسين التعامل مع الاستثناءات.
- وأساليب انتقدت إزالتها.
- وتوسيع البرنامج التعليمي BioJava.
- وتبعيات تحديث حيثما ينطبق ذلك.
- والمتوفرة على مخضرم الوسطى.
ما هو جديد في الإصدار 4.0.0:
- وتسجيل الخطأ واتساقا. يستخدم SLF4J لقطع الأشجار وتوفر محولات لجميع تطبيقات تسجيل الكبرى.
- وتحسين التعامل مع الاستثناءات.
- وأساليب انتقدت إزالتها.
- وتوسيع البرنامج التعليمي BioJava.
- وتبعيات تحديث حيثما ينطبق ذلك.
- والمتوفرة على مخضرم الوسطى.
ما هو جديد في الإصدار 3.1.0:
- وميزات جديدة:
- والإصدار 1.4 CE-CP، مع معلمات إضافية
- وتحديث لنطاق 2.04
- وتحسينات في FASTQ تحليل
- واصلاح الخلل في PDB تحليل
- وإصلاحات طفيفة في التحالفات هيكل
ما هو جديد في الإصدار 3.0.8:
- والجديد:
- وبنك الجينات الكاتب
- ومحلل لملف النمط النووي من UCSC
- ومحلل للمواقع الجينات من UCSC
- ومحلل لأسماء جين ملف من genenames.org
- وحدة لكوكس كود الانحدار لتحليل البقاء على قيد الحياة
- وحساب المساحة السطحية الوصول (ASA)
- وحدة لتحليل ملفات .OBO (أنطولوجيات)
- وتحسين:
- وتمثيل SCOP وبيركلي-SCOP التصنيفات
ما هو جديد في الإصدار 3.0.7:
- واضاف محلل بنك الجينات الأساسية .
- وإصلاح مشكلة عند ترجمة الكودونات مع N.
- والآن يمكن أن يستنتج السندات في هياكل البروتين.
- واضاف لدعم تحليل سجلات mmcif لكائن ونظام التعبير.
- والعديد من الاصلاحات والتحسينات الصغيرة.
ما هو جديد في الإصدار 3.0.6:
- وانتقلت التنمية جيثب في: HTTPS: // github.com/biojava/biojava
ما هو جديد في الإصدار 3.0.5:.
- ومحلل جديد لتصنيف CATH
- ومحلل جديد لتنسيق الملف ستوكهولم.
- وتحسن كبير في تمثيل التجمعات البيولوجية من هياكل البروتين. الآن يمكن إعادة إنشاء الجمعية البيولوجي من وحدة غير متكافئة.
- وإصلاحات العديد من الأخطاء.
ما هو جديد في الإصدار 3.0.4:
- وهذا هو أساسا خلل الإصدار معالجة القضايا في هيكل واضطراب البروتين وحدات.
- واحد ميزة جديدة: ويمكن الآن البيانات SCOP يمكن الوصول إليها سواء من موقع سكوب الأصلي في المملكة المتحدة أو إصدار بيركلي
ما هو جديد في الإصدار 3.0.3:
- وتحسينات كبيرة على وحدة خدمة الويب (NCBI الانفجار والخدمات hmmer الويب).
- و& مثل؛ الجديدة ومثل؛ محلل fastq (استدار من سلسلة biojava 1 إلى الإصدار 3).
- ودعم تنخل-PDB لرسم الخرائط UniProt.
- وحدة Protmod تسمية لmodfinder.
ما هو جديد في الإصدار 3.0.2:
- والبروتين هيكل: تحسين التعامل مع المجالات البروتين: الآن يدعم SCOP. وظائف جديدة للتنبؤ الآلي من المجالات البروتين، على أساس بروتين محلل المجال.
- وتحسينات طفيفة وإصلاح الأخطاء في عدة وحدات أخرى.
- وbiojava3-AA-دعامة: هذه الوحدة الجديدة تسمح للحساب الكيميائية الفيزيائية وغيرها من الممتلكات من سلاسل بروتين .
- وbiojava3 البروتين-اضطراب: وحدة نمطية جديدة للتنبؤ المناطق المضطربة في البروتينات. واستندت على تنفيذ جافا للتنبؤ RONN.
<قوية> ما هو جديد في الإصدار 3.0.1:
- والافراج 3.0.1 هو أساسا إصلاح الأخطاء الإفراج عن الأخير 3.0 الإفراج التي وفرت كتابة الرئيسية للقانون الأساس biojava.
<قوية> متطلبات : ل
- وجافا 1.6 أو أعلى
لم يتم العثور على التعليقات