شتادين حزمة هو مجموعة كاملة النمو التجمع تسلسل الحمض النووي (Gap4)، والتحرير، وأدوات التحليل (سبين) ليونكس، لينكس، ماكوسكس ويندوز من مايكروسوفت.
على الجبهة Gap4 كانت هناك العديد من قاصر انضمامه ذات الصلة
تحسينات في كيف عشرات ينضم في إيجاد ينضم الداخلية و
وظيفة الزر محاذاة في تاريخ محرر.
أيضا نتيجة لgap4 هي التغييرات المختلفة لio_lib (ل
مكتبة لجميع I / O لمختلف صيغ ملف التتبع). مع إضافة
برنامج hash_exp الجديد الذي يسمح الآن لملفات التجربة لتكون
متصلا معا وفهرستها. قائمة أسماء الملفات التجربة
يجب أن يزال خارج توفيره لgap4، لكنها وفرت البيئة EXP_PATH
متغير تم تعيين بشكل صحيح gap4 سوف تكون قادرة على جلب فرد
متواليات من الملف التجربة متسلسلة
الأرشيف. تحسينات على واجهة المستخدم لهذا لا تزال بحاجة إلى أن يكون
قدم.
يتم الآن بدعم 454 المحفوظات SFF أفضل. وdefsult 454 مؤشرات
العمل الآن، على الرغم من أن برنامج hash_sff يمكن استخدامها لتوفير
فهرسة استراتيجية بديلة (ربما أسرع في بعض الحالات).
Gap4 وإن Trev أيضا أن يكون نمط آخر تتبع العرض للآثار التي
ديك 1 عينة المسح (قنوات X4) لكل مكالمة القاعدة. في هذه الحالة ما في وسعها
كما رسم 4 القيم الثقة بدلا من 1 لكل قاعدة. هذه القدرات
تسمح تكامل أفضل من Solexa يتتبع عندما بسهولة أكبر
المتاحة.
بالإضافة بالطبع هذا المزيج المعتاد من إصلاحات الشوائب والقرص طفيفة. رؤية
سجل للحصول على التفاصيل كاملة التغيير (عن طريق موقع سورس).
التغييرات البارزة الأخرى
Gap4
لم يتم العثور على التعليقات