ويوفر BioRuby بيئة متكاملة لالمعلوماتية الحيوية (علم الأحياء علم المعلومات).
وجوه المنحى لغة البرمجة روبي ديها العديد من الميزات المناسبة للبحوث المعلوماتية الحيوية، على سبيل المثال، تركيب واضحة للتعبير عن كائنات معقدة، والتعبيرات العادية للتعامل مع النص قوية مثل بيرل و؛ [س]، ومجموعة متنوعة واسعة من المكتبات بما في ذلك خدمة الإنترنت الخ
كما بناء الجملة روبي بسيط ونظيف جدا، ونحن نعتقد أنه من السهل معرفة للمبتدئين، وسهلة الاستخدام لعلماء الأحياء، وكذلك قوي بما فيه الكفاية لمطوري البرمجيات.
في BioRuby، يمكن للمطور استرداد إدخالات قاعدة البيانات البيولوجية من ملفات مسطحة، خوادم شبكة الإنترنت وقواعد البيانات العلائقية المحلية.
يمكن تحليل هذه الإدخالات قاعدة البيانات لاستخلاص المعلومات التي تحتاج إليها. ويمكن علاج متواليات البيولوجية مع وسائل رغدة من روبي &؛ [س] الفئة سلسلة ومع التعابير العادية.
مكتبة يمكن دمجها مع أدوات مثل انفجار، فاستا، Hmmer والعديد من حزم البرامج الأخرى للتحليل البيولوجي.
BioRuby يدعم تنسيقات قاعدة البيانات البيولوجية الرئيسية، ويوفر العديد من الطرق للوصول إليها من خلال الفهرسة flatfile، SQL، وخدمات الويب الخ خدمات الويب المختلفة بما في ذلك KEGG API يمكن استخدامها بسهولة من قبل BioRuby
الميزات:.
< P> BioRuby قذيفةAPI
توثيق
المتطلبات:
روبي 1.8.7 أو أعلى
لم يتم العثور على التعليقات