ZOOM ايت هو الجيل المقبل من البيانات ورسم الخرائط تسلسل والتصور البرمجيات. الجينوم المستخدمين إشارة المدخلات والبورشيد / Solexa باختصار يقرأ الملفات أو AB الفضاء بلون يقرأ الملفات في أشكال مختلفة، مثل * .fasta، * .fastq، * _seq.txt، * .csfasta الخ ZOOM إخراج نتائج رسم خرائط لهذه باختصار يقرأ على تسلسل المرجعية. ZOOM لايت لديها خرائط النواة بسرعة ودقة على أساس نظرية متباعدة متعددة البذور المصممة حديثا. كلا نهاية واحدة وإقران نهاية يقرأ من أطوال مختلفة من 15bp إلى 240bp يمكن التعامل معها. ويسمح لأي عدد من حالات عدم التطابق والإدراج واحد / حذف أطوال مختلفة بين القراءة والمنطقة المستهدفة على تسلسل المرجعية. سيتم إبلاغ النتائج معين فريد أو أفضل (أعلى N) النتائج لكل قراءة وفقا لتفاوت الحد الأدنى وطول INDEL. وتستخدم نقاط جودة لتعزيز دقة رسم الخرائط. على أساس نواة رسم الخرائط، ZOOM لايت يتيح للمستخدمين تحميل قراءة البيانات المحلية وتسلسل البيانات المرجعية، حدد المعلمات المناسبة، معالجة البيانات ارتفاع حجم بالتوازي بين ما يصل إلى أربع وحدات المعالجة المركزية، ورصد المهام قيد التشغيل، تخزين نتائج رسم الخرائط، وعرض الرسوم البيانية لل النتائج رسم الخرائط والنتائج رسم الخرائط الانتاج في أي .BED * * أو تنسيقات الملفات .GFF لمزيد من المسح مع UCSC معلومات المسار المتصفح. النتائج رسم الخرائط يمكن أن ينظر في أي نطاق المطلوب، من الرسم البياني عمق قراءة أكثر من كروموسوم كامل لالاصطفافات تسلسل مفصل بين يقرأ وتسلسل المرجعية. للمستخدمين التنقل بسهولة إلى المناطق ذات الاهتمام ببساطة عن طريق النقر والسحب أو التمرير. ZOOM لايت هو مشتق من البرنامج ZOOM ستوديو
ما هو الجديد في هذا الإصدار:.
الإصدار 1.5 يتضمن شكل SAM التصدير، والهندسة المعمارية ضبط، أفضل الأمثل رمز، أصغر برنامج حجم ثنائي، وdabase ترقية engining للحصول على أداء أفضل.
لم يتم العثور على التعليقات