MacMolPlt

وMacMolPlt هي أداة التصور الكيمياء التي يمكن استخدامها لبناء الجزيئات مع نموذج متكامل باني رسومية، وخلق ملفات الإدخال لبرنامج الكيمياء الحسابية GAMESS، ومن ثم تصور نتائج أشواط الكيمياء الحسابية. وتشمل الميزات عرض 3D عالية الجودة، والرسوم المتحركة من وسائط العادية ومتواليات رد فعل والإخراج إلى مجموعة متنوعة من الأشكال بما في ذلك الصور ذات جودة عالية وكويك تايم وفلاش الأفلام.

الإدخال باستخدام: لكمات تنسيق ملف MolPlt بها GAMESS بواسطة اللصق في الإحداثيات الديكارتية من أي ملف سجل GAMESS أو جاوس أي مساهمة GAMESS، تسجيل أو ملف ملف IRC Xmol أسلوب XYZ مولدن شكل ملفات البروتين بنك المعلومات (فوسفات) ملف لغة توصيف النص الكيميائية (CML) الملفات بناء بيانيا مع محرر جزيء تفاعلي بناء من ناحية استخدام أسلوب ديكارتي أو Z-مصفوفة الداخلي عرض الإحداثيات 3D من هيكل وعادي الرسوم المتحركة وضع من أوضاع العادية. 3D في الوقت الحقيقي التناوب والترجمة تحت السيطرة الماوس حساب أي معلمة Z-مصفوفة مسافات بصريا مقياس / عرض والزوايا وdihedrals. إنشاء آلية للالخطي بأقل الحركة (LLM) مسارات 2D و 3D حساب وعرض: المدارات الجزيئية (في AO، في MO، أو الكائنات الحية المحورة و) إجمالي الكترون الخلافات الكثافة الكثافة الجزيئية كهرباء إمكانيات (MEPMaps) مولد ملف الإدخال الأساسي للGAMESS برنامج OpenGL المستخدمة لالعالية جودة 3D تقديم الدعم لالتماثل الجزيئي توليد التماثل ذرات تعتمد تحديد مدى اتساق ذرات فريدة تلقائيا تحديد قائمة الجماعات نقطة دعم لمجموعة من الإحداثيات. تنسق استدارة إلى مشغلي التماثل التوجه العرض المبدأ السليم لكثير من مجموعات نقاط جودة الانتاج النشر (اللون أو أبيض وأسود) عن طريق الطباعة المباشرة أو نسخ ولصق في تطبيق آخر. الانتاج في مجموعة متنوعة من الأشكال بما فيها ويندوز نقطية، JPEG، PNG، CML، XMol XYZ، MDL MolFile وثنائي بوف راي، أفلام فلاش وأفلام كويك تايم.

ما هو الجديد في هذا الإصدار:

وقد تم إجراء عدة تحسينات على قانون العرض. تم إضافة خيارات لجزء 3D من prefernces لالتظليل على نحو سلس مع وبدون الظلال.
واضاف لدعم بدائية لملفات MOPAC.
خيار للتبديل الرؤية من أساسه، MM، والذرات المتفجرات المخترقة للدروع المضافة.
تحسين الدعم لنموذج الأساسية الإمكانيات.
وأضاف هوك في بناء مدخلات لبرنامج GAMESSQ الجديد.
تحسين محلل ملف PDB.