وNetworkX هو حزمة بايثون لخلق، والتلاعب، ودراسة ديناميكية، وهيكل، ووظائف شبكات معقدة الميزات:. يتيح لل1M + العقد، 10M + حوافيشمل القياسية الرسم البياني-النظريه وظائف الفيزياء الإحصائيةتبادل سهل من خوارزميات الشبكة بين التطبيقات والتخصصات، ومنصاتيتضمن العديد من الرسوم البيانية الكلاسيكية وشبكات الاصطناعيةالعقد...
وreciprocal_smallest_distance هو خوارزمية orthology البشرى يستخدم محاذاة تسلسل العالمية والحد الأقصى احتمال المسافة التطورية بين متواليات ليكشف بدقة orthologs بين الجينوم.تثبيت من كتل القطرانتحميل وuntar أحدث نسخة من جيثب:مؤتمر نزع السلاح ~-L حليقة...
وGPdotNET هو أداة الذكاء الاصطناعي لتطبيق البرمجة الجينية والخوارزميات الجينية في النمذجة والأمثل للمشاكل الهندسية المختلفة. ومن الصافي (مونو) طلب خطي في C # لغة البرمجة التي يمكن تشغيلها على كل من Windows و Linux OS.التي GPdotNET في عام 2006 ضمن مشروع التخرج لالنمذجة والأمثل مع الخوارزميات التطورية. كمشروع مفتوح...
وبناء نظم مثل جعل كثير من الأحيان يتم استخدامها لإنشاء سير العمل المعقدة، على سبيل المثال في المعلوماتية الحيوية على & nbsp؛ وتهدف snakemake للحد من تعقيد خلق سير العمل من خلال توفير مجال اللغة نظيفة وحديثة محددة المواصفات (DSL) في الاسلوب الثعبان، جنبا إلى جنب مع بيئة تنفيذ سريعة ومريحة.تركيب- في أوبونتو 12.04، يمكنك...
ومشروع Geant4 هو مجموعة أدوات لمحاكاة مرور الجزيئات من خلال الموضوع.وتشمل مجالات تطبيقه فيزياء الطاقة العالية والتجارب النووية، مسرع وفيزياء الفضاء الدراسات الطبية ما هو الجديد في هذا الإصدار:. نموذج جديد من التفاعلات النووية جاما باستخدام برتيني تمت إضافة تتالي.تم عرض نموذج برتيني لpi-، K-، وسيغما لالتقاط النووي...
وبدأ المشروع STEME الحياة كما تقريب للخوارزمية التوقع-Maximisation لنوع النموذج المستخدم في المكتشفون عزر مثل MEME.STEME و؛ [س] EM تقريب يدير أمر من حجم أسرع من تنفيذ MEME لإعدادات المعلمة النموذجية. وقد وضعت STEME الآن إلى مكتشف عزر كامل العضوية في حد ذاتها.لماذا استخدام STEME؟تقنيات النتيجة عزر ثبتويستند STEME على...
وGenepidgin هو مجموعة من الأدوات التي تساعد في بيثون تقييم وتعيين جين أسماء المنتجات على & nbsp؛ هناك ثلاثة عناصر أساسية:genepidgin * أنظف *على & nbsp؛ توحد أسماء الجين في المبادئ التوجيهية تسمية UNIPROTgenepidgin * مقارنة *على & nbsp؛ يقارن مجموعتين أو أكثر من أسماء الجينgenepidgin * حدد *على & nbsp؛ يختار اسم المنتج...
وESMF (إطار نمذجة نظام الأرض) هو برنامج لبناء عالية الأداء، والبنية التحتية البرمجيات مرنة لزيادة سهولة الاستخدام، وقابلية الأداء والتشغيل البيني، وإعادة استخدامها في المناخ والتنبؤ العددي بالطقس، تمثل البيانات، وESMF يحدد بنية ليؤلف المعقدة، نظم النمذجة إلى جانب وتضم هياكل البيانات والمرافق العامة لتطوير نماذج...
وقفيصة هي عبارة عن منصة شاملة مفتوحة المصدر والذي يدمج خط أنابيب الحسابية عالية الأداء لتحديد تسلسل الممرض & nbsp؛ و توصيف في الجينومات البشرية وtranscriptomes جنبا إلى جنب مع قاعدة بيانات النتائج قابلة للوعلى شبكة الإنترنت تطبيق البرمجيات سهلة الاستخدام لإدارة، الاستعلام عن وتصور النتائج.ابدءسوف تحتاج إلى قاعدة...
وMISO (خليط من الأشكال الإسوية) هو إطار احتمالي مكتوبة في بيثون أن quantitates مستوى التعبير على & nbsp؛ من الجينات تقسم بدلا من البيانات RNA يليها، ويحدد الأشكال الإسوية المنظمة تفاضلي أو الإكسونات عبر العينات.عبر الاقتداء عملية توليدي التي يتم إنتاجها من الأشكال الإسوية في RNA تسلسل يقرأ، يستخدم نموذج MISO الاستدلال...
