وSPInDel هو نهج بديل لتحديد البيولوجي على أساس طول RNA الريباسي (الرنا الريباسي) مناطق الجينات. بشكل عام، التحالفات الريباسي الأساسي تسلسل الجين من الأنواع المختلفة تظهر المناطق بالتناوب الحفاظ على النوكليوتيدات والاختلاف، سواء من حيث استبدال النوكليوتيدات (المعروفة باسم "تعدد الأشكال") والإدراج / حذف (INDEL) الأحداث. وجود نتائج indels في متواليات من أطوال مختلفة ويدخل الثغرات في المحاذاة، يرمز عادة من قبل شرطة "-".
مفهومنا لتحديد البيولوجي يستخدم تسلسل الجينات الريباسي على النحو التالي: يتم استخدام مناطق الحفظ لتحديد شرائح متغيرة ("المناطق SPInDel hypervariable") التي مزيج من تسلسل أطوال هو سمة من كل الأنواع ("صورة SPInDel"). وهكذا، كل الأنواع يمكن أن يحددها لمحة رقمية فريدة من نوعها.
من الناحية النظرية، دراسة استقصائية لمجرد 6 مناطق hypervariable مع كل 20 الأليلات (أو 11 مناطق مع 5 الأليلات لكل منهما) ما يكفي للتمييز جميع الأنواع حقيقية النواة على الأرض، والتي تشير التقديرات إلى أن ما بين 5 و 15 مليون في العدد. في الممارسة العملية، SPInDel غير قادرة على التمييز 93.3٪ من الأنواع حقيقية النواة مع انخفاض التباين ضمن النوع وقرار النشوء والتطور عالية.
لم يتم العثور على التعليقات