وPathomx (MetaPath سابقا) هو مفتوح المصدر البرمجيات الرسومية تنفيذها في IPython، كيو تي وبيكت، وقد تم تصميمها من الألف إلى الياء ليكون بمثابة أداة تفاعلية لتصور وتحليل البيانات الأيضية تحت جنو / لينكس وغيرها من POSIX على & nbsp؛ التشغيل الأنظمة. تم تصميم في البداية لاستخدامها لمعالجة الايض data.Features في ملامح glanceKey تشمل تقديم الدعم لاستيراد وتصدير NMR (الرنين النووي المغناطيسي) البيانات وتجهيزها الأطياف، بما في ذلك التطبيع، binning والمواءمة، وكذلك التمثيل الغذائي التصور مسار والتعدين. سوف تكون قادرة على استيراد البيانات الجينومية والايض من خلال طرق مختلفة لتصور على مسارات محددة أيضا.
وشملت مختلف الشروح قاعدة بيانات ميتاسيك أيضا في تطبيق Pathomx، من بينها يمكن أن نذكر الروابط توحيد قاعدة البيانات، والمترادفات، وكذلك مسارات المرتبطة بها وردود الفعل. يرجى ملاحظة أن قاعدة البيانات ميتاسيك مشتق من API العام.
يستخدم التطبيق قاعدة البيانات ميتاسيك قوية لاستكشاف السريع لمجموعات البيانات المعقدة، وذلك بفضل للمد والإضافات شكلي. وبالإضافة إلى ذلك، فإنه يستخدم مكتبات Numpy وScipy لعدد المناولة، Matplotlib عن الرسوم البيانية، nmrglue لNMR استيراد البيانات، d3.js عن الرسوم البيانية التفاعلية، وscikit-يتعلم للتحليل الإحصائي methods.Under غطاء محرك السيارة ودعم OSesLooking تحت غطاء محرك السيارة من Pathomx، يمكننا أن تلاحظ أن التطبيق قد تم بناء على IPython قذيفة القيادة. كما أنها تعمل بشكل جيد في ظل أنظمة التشغيل مايكروسوفت ويندوز وماك OS X، والذي كان متوفرا للتحميل على شكل حزم ثنائي بنيت قبل. لجنو / لينكس، يتم توزيع البرنامج فقط كأرشيف مصدر gzipped متوافق مع 32 بت و 64 بت منصات الأجهزة.
عند استخدام Pathomx، يجب على المستخدمين أن نضع في اعتبارنا أن تطبيق يجعل استخدام البيانات من قاعدة بيانات مسار ميتاسيك نفسها، والتي هي جزء من عائلة BioCyc. يتم استخدام API ميتاسيك لتوليد قاعدة البيانات الموردة، والتي يتم تخزينها محليا
ما هو الجديد في هذا الإصدار:.
وأضيفت السحب والإفلات محرر بصرية جديدة تماما.
انها تسمح لك لخلق مسارات التحليل عن طريق سحب الأدوات في مساحة العمل، وتحرير الاتصالات عن طريق سحب خطوط البيانات بين الأدوات، وباستخدام طرق المضمنة للحصول على لمحة عامة عن المعالجة الحالية.
يمكن إسقاط البيانات في مساحة العمل للاستيراد الفورية.
وأضافت أيضا الحية لكل أداة الإخطارات، والحانات، ومؤشرات الحالة التقدم.
يتم وضع علامة الأخطاء مع نص التعليمات (تلميحات بشأن الأدوات عندما أشار الأحمر).
المتطلبات:
غراففيز
لم يتم العثور على التعليقات