يوفر الجينوم على نطاق مرنا التنميط لقطة من الحالة العالمية للخلايا في ظل ظروف مختلفة. ومع ذلك، لا مستويات مرنا لا توفر الفهم المباشر من الآليات التنظيمية المنبع. Expression2Kinases (X2K) هو نهج جديد لتحديد المنظمين المنبع المسؤولة على الأرجح عن التغيرات الملحوظة في الجينوم على نطاق التعبير الجيني. من خلال دمج رقاقة وما يليها / رقاقة وموقف الوزن المصفوفات (PWMs) البيانات، وتفاعلات البروتين البروتين، وتفاعلات الفسفرة كيناز الركيزة X2K يمكن استخدامها لتحديد الآليات التنظيمية المنبع من الاختلافات على مستوى الجينوم في التعبير الجيني. والفكرة هي أن نستنتج أولا عوامل النسخ الأكثر احتمالا أن تنظيم الاختلافات في التعبير الجيني، ثم استخدم تفاعلات البروتين البروتين لربط عوامل النسخ التي تم تحديدها باستخدام بروتينات إضافية لبناء شبكات فرعية التنظيمية النسخي تركز على هذه العوامل، وأخيرا استخدام كيناز الركيزة ردود الفعل الفسفرة البروتين، لتحديد ومرشح رتبة البروتين كيناز أن الأرجح تنظيم تشكيل المجمعات النسخي التي تم تحديدها. كما يحتوي X2K الأدوات اللازمة لأداء الجينات القائمة يحلل التخصيب والتنبؤ الأدوية التي يمكن أن تنقض أو تفاقم التغيرات في التعبير الجيني. ويمكن للنهج X2K تقدم فهمنا لآليات الإشارات الخلوية والمخدرات كشف العمل
المتطلبات:.
بيئة جافا 6.0
لم يتم العثور على التعليقات