وPathVisio هو مفتوح المصدر وتطبيق رسومية خالية تماما تنفيذها في لغة البرمجة جافا والمصممة من الألف إلى الياء ليتم استخدامها لعرض وتحليل وتحرير المسارات البيولوجية تحت التشغيل جنو / لينكس system.Can أن تستخدم لرسم مسارات ، ربط البرمجيات entitiesThe البيولوجي يتيح للمستخدمين رسم مسارات، ربط الكيانات البيولوجية (البروتينات أو الجينات) للبيانات البيولوجية، وذلك باستخدام معرفات قاعدة البيانات، وتحرير مسارات، وكذلك لتحليل مسارات. مع PathVisio سوف تكون قادرة على تعيين البيانات التجريبية، مثل البيانات ميكروأري، وتصور على رأس الرسم مسار القائمة أيضا.
وبالإضافة إلى ذلك، سوف تكون قادرا على تحديد قاعدة بيانات الجينات، حدد قاعدة بيانات الأيضية، وعرض إحصائيات وبيانات التعبير الاستيراد، حدد مجموعة البيانات التعبير ومسارات البحث، وعرض أسطورة، والتعامل مع الأشياء، ومشاريع الاستيراد، وكذلك لتثبيت وإدارة الإضافات، التي يمكن أن تضيف وظائف إضافية إلى app.Requires يمكن استخدام أي تطبيق installationThe دون تثبيته على نظام التشغيل جنو / لينكس الخاص بك. كل ما عليك القيام به هو تنزيل حزمة الثنائية من Softoware، حفظ الأرشيف في الموقع الذي تختاره، واستخراج باستخدام أداة مدير الأرشيف، فتح الدليل المستخرج، وانقر مرتين على pathvisio.jar file.Under في hoodWhile إلقاء نظرة سريعة تحت غطاء محرك السيارة من البرنامج PathVisio، ونحن و[رسقوو]؛ [ف لاحظ أن تطبيق هو مكتوب تماما في لغة البرمجة جافا، والتي واجهة المستخدم الرسومية التي تم تصميمها مع أحدث تقنيات جافا سوينغ. نحن و [رسقوو]؛ هاء اختبار التطبيق على أجهزة الكمبيوتر دعم أي من architectures.Runs CPU 32 أو 64 بت على أي نظام تشغيل حيث يتم supportedBeing مكتوبة جافا في لغة البرمجة جافا بنجاح، PathVisio يمكن تعريف تطبيق منصة مستقلة تدعم جنو / لينكس مايكروسوفت ويندوز، ماك OS X، BSD، وسولاريس، وأي نظام تشغيل آخر حيث يتم دعم أحدث تقنيات جافا
ما هو الجديد في هذا الإصدار:.
31 يناير 2014: علة إصدار إصلاح
تتم إزالة حيث GeneOntology الآن من نتائج البحث عن الشروح
تحتاج DataNodes أن المشروح مع ID ومصدر البيانات أو لا شيء (إنقاذ العقد البيانات مع الوحيد ID أو مصدر بيانات لا يسمح بعد الآن)
ما هو الجديد في الإصدار 3.1.2:
خلل كبير في وحدة ملف الاستيراد ثابتة: http://developers.pathvisio.org/ticket/1697
ما هو الجديد في الإصدار 2.0.11:
الحفظ التلقائي
تكبير باستخدام عجلة التمرير
اختيار خطوط أسهل: لم يعد من الضروري الضغط على بكسل المحدد
الآن مع اثنين من طرق التمثيل المفرط التحليل؛ واحدة موجهة نحو مسار واحد البيانات المنحى
ما هو الجديد في الإصدار 2.0.10:
طريقة جديدة لرسم تقريب المستطيلات لتجنب تمتد تأثير
بوجفيكسيس صغيرة مختلفة
ما هو الجديد في الإصدار 2.0.9:
نوع الموصل جديد للموصل من طول التعسفي وزوايا التعسفية
الجديدة ومثل، المكون الخلوي ومثل. الملكية لتخزين معنى البيولوجي للمقصورة
الجديدة ومثل، وضعف مثل؛ نوع الخط (مفيدة بشكل خاص للعضيات مزدوجة membraned)
وصلات قابلة للنقر في الممرات
نرى معلما: ومثل، milestone_27 ومثل. للحصول على قائمة كاملة من علة إصلاحات
ما هو الجديد في الإصدار 2.0.8:
تحسين الأشكال عن المكونات الخلوية
وهناك عدد قليل قابليتها للاستخدام التحسينات مثل نسخ / لصق في القائمة المنبثقة
نرى معلما: ومثل، milestone_26 ومثل. للحصول على قائمة كاملة من علة إصلاحات
ما هو الجديد في الإصدار 2.0.7:
أيقونات شريط الأدوات ولوحة جانبية جديدة لجعله أسهل لتحديد أنواع الأسهم والأشكال (بفضل liubing)
يتم تضمين قواعد البيانات مسار كمصدر بيانات، بحيث يمكنك إضافة وصلات من مسار واحد إلى آخر
تم تحسين تحويل BioPAX وتنتج وثائق BioPAX أكثر صحة.
جديد نوع الموصل حيث النقاط الفردية يمكن التلاعب بها (بفضل leonth)
وقد زاد عدد من مصادر البيانات لأكثر من 180
نرى معلما: ومثل، milestone_25 ومثل. للحصول على قائمة كاملة من علة إصلاحات
ما هو الجديد في الإصدار 2.0.6:
وعدد من المراسي على شكل ويمكن زيادة من الافتراضي 12.
ويمكن الآن أظهرت أسطورة من التصور البيانات على صورة المسار نفسه. في السابق كان مرئيا فقط في لوحة جانبية.
نرى معلما: ومثل، milestone_24 ومثل. للحصول على قائمة كاملة من علة إصلاحات
ما هو الجديد في الإصدار 2.0.4:
تحسين تنسيق النص من الأشكال، والعلامات وdatanodes
العديد من الأشكال لdatanodes
إحداثيات بكسل بسيطة
لون الخلفية تعيين على datanodes
ما هو الجديد في الإصدار 2.0.3:
أبرز في هذا الإصدار هو مخطط XML الجديد لتنسيق مسار البرنامج العالمي (الإصدار 2010A). وهذا شكل المسار الجديد سيمكن العديد من القدرات الرسومية الجديدة في المستقبل، يمكنك نتطلع إلى بعض من تلك التي تظهر في الإصدار القادم.
الميزات الجديدة الأخرى:
المراسي غير مرئية غير مرئية حقا، على الأقل عند توصيل شيء لهم (شكرا لمارغو)
خيار إضافي سطر الأوامر -v (بفضل مارك)
حاليا يتم عرض قاعدة البيانات المحددة بشكل صحيح في شريط الحالة مرة أخرى
العديد من النقاط تمديد جديدة للالمساعد للمطورين
نرى معلما: ومثل، milestone_21 ومثل. للحصول على قائمة كاملة من علة إصلاحات
ما هو الجديد في الإصدار 2.0.1:
تحسين خوارزمية للموصلات التلقائية التي تشير إلى مرساة.
تحسين الرسم من أنواع الأسهم التي لها قصيرة ومثل، مثل الفجوة و. في النهاية.
لأنه قد تم إلغاء خدمة freemail THAWTE، قمنا بتحديث شهادة الأمن لدينا
لم يتمكن المشاهد المسار التاريخ الخلل فيها واعتبرت كل سطر المعدلة، حتى لو لم يكن. تم إصلاح هذا.
المتطلبات:
أوراكل جافا الإصدار القياسي للبيئة وقت التشغيل
لم يتم العثور على التعليقات