الخلية الكهربية محاكاة البيئة (CESE) هو إطار شامل مصمم خصيصا لأداء المحاكاة الحاسوبية الكهربية، على سبيل المثال، والمحاكاة من النشاط الكهربائي في القلب العضلية.
الخلية الكهربية محاكاة بيئة غير مفيدة لمحاكاة إمكانات العمل، والتيارات الأيونية الفردية، والتغيرات في تركيزات الأيونية.
CESE هو برنامج عبر منصة، فإنه يعمل على أي نظام يحتوي جافا بيئة وقت التشغيل (JRE) الإصدار 1.4 أو أعلى. تم اختباره على ويندوز، لينكس، وسولاريس، ماكنتوش، وAIX.
المستخدمين CESE
CESE هو بيئة متكاملة لأداء المحاكاة الحاسوبية باستخدام مجموعة متنوعة من نماذج الكهربية.
في هذه المرحلة CESE يسمح بإنشاء وتنفيذ نماذج وحيدة الخلية (التي تحتوي على حد سواء هودجكين هكسلي (HH) والتركيبات الحالية ماركوف). يتم تضمين نماذج من النشاط الكهربائي من myocytes القلب مع شفرة المصدر في توزيع CESE. نأمل أن تمديد عدد من النماذج المتاحة، وإضافة بعض النماذج العصبية في المستقبل.
القوة الرئيسية من CESE هو في التوحيد في & # 65533؛ واجهة البرنامج لا يزال هو نفسه لأنواع مختلفة من النماذج. يمكنك التبديل بسهولة بين النماذج ومقارنة مخرجات المحاكاة. يمكن تعديل المعلمات النموذج، تم اختيارها للإخراج و / أو فرضت في نفسه، وطريقة قياسية.
CESE يمتد المعنى التقليدي الكهربية من "المشبك الجهد". يمكنك المشبك تقريبا أي متغير النموذج، بما في ذلك الجهد (غشاء المحتملة)، ومجموع أو الفردية التيارات الأيونية، وتركيزات الأيونية، ودرجة الحرارة، والمتغيرات النابضة، وما يمكن أن الأوامر لقط أن تكون وظائف من قطعة والحكمة معقدة، تعيين فردي للمتغير نموذج من الفائدة . هذا يفتح احتمالات لا نهاية لها لاستكشاف السلوك نموذج معقد.
يوفر CESE تصورات بيانات بسيطة، ولكنها فعالة. ويمكن عرض نتائج المحاكاة في أشكال بيانية وجداول. يمكن تخصيص قطع الأراضي، والمناطق ذات الاهتمام التكبير.
على الرغم من CESE لم يصمم ليكون أداة تحليل البيانات، يمكنك إنشاء العلاقات الجهد الحالي (I-مقابل) وحساب المعلمات الإحصائية للإشارة معينة داخل البرنامج. يمكنك تصدير البيانات إلى ASCII، أكسون ملف نصي (ATF)، وصيغ NetCDF على مواصلة التحليل في حزمة المفضلة لديك.
المطورين CESE
تم إنشاء CESE من الألف إلى الياء لدمج أفضل الممارسات البرمجة المتاحة لمطوري جافا، سواء من حيث واجهة المستخدم الاتساق والوضوح رمز وإعادة استخدامها. حيثما كان ذلك ممكنا، CESE تعتمد على واجهات برمجة التطبيقات جافا المتاحة (على سبيل المثال Java2D، JavaBeans، JAXP) لتبسيط التعليمات البرمجية.
إنشاء نموذج يتطلب عددا من المهام لحفظ المنزل لتكون مشفرة & # 65533؛ وتشمل هذه تكامل ODE، إجراءات للتعامل مع المعلمات نموذج، وتوفير / استعادة دولة نموذجية، تصور نتائج المحاكاة، الخ CESE يوفر لك التنفيذ لهذه الإجراءات، وبالتالي، يمكنك التركيز على كتابة رمز لتيار الأيونية الخرسانة (ق)، و سوف CESE التعامل مع بقية.
CESE لا تحاول خلق أطر البرمجة معقدة على 65533 الخاصة & #؛ بدلا من ذلك، فإنه يستخدم واجهات برمجة التطبيقات جافا الأساسية. على سبيل المثال، ونماذج هي مكونات Java مطابقة للمواصفات JavaBeans. نستخدم XML لتحديد الأوامر لقط، وجافا وجوه التسلسل لحفظ / استعادة معالم النموذج.
ما هو الجديد في هذا الإصدار:
لم يتم العثور على التعليقات