CodonW هو برنامج مصمم لتبسيط التحليل متعدد المتغيرات (تحليل المراسلات) من استخدام كودون والأحماض الأمينية. كما تحسب المؤشرات القياسية للاستخدام كودون. انها على حد سواء القائمة واجهة سطر الأوامر.
كتب المشروع CodonW التي كتبها جون بيدن في مختبر بول شارب، قسم علم الوراثة في جامعة نوتنغهام. ويعمل جون في علم الوراثة البشرية ويعمل حاليا كمدير قاعدة بيانات ProCardis في WTCHG في جامعة أكسفورد.
وهنا بعض الملامح الرئيسية "CodonW":
· كتب في ANSI C متوافق
· القائمة مدفوعة
· عدد واسع من خيارات سطر الأوامر
شفرة وراثية مستقلة
· لا حدود ل
1. عدد من متواليات
طول 2. تسلسل
وتحسب مؤشرات استخدام كودون
مؤشر التكيف تسلسل معلومات النظام الجيني: 1. CAI
2. المتأنق: تردد من الكودونات الأمثل
3. نورث كارولاينا: عدد الفعال للكودونات
4. CBI: مؤشر التحيز تسلسل معلومات النظام الجيني
وتحسب مؤشرات الأحماض الأمينية
النتيجة 1. المرق
2. الأروماتية
وتحسب تحليل المراسلات
1. تسلسل معلومات النظام الجيني الاستخدام
2. RSCU (النسبي استخدام كودون مرادف)
3. استخدام حمض أميني
· تحليل المراسلات
1. يمكن أن تشمل / استبعاد الكودونات / الأحماض الأمينية
2. الحصول على تقارير مفصلة الاتجاهات
3. محاولات لتحديد الكودونات المثلى تلقائيا
4. يمكن أن تسمح بيانات إضافية مجموعات لتضاف
5. يسجل أي عدد من الاتجاهات
وتحسب المعلمات الجينات
1. طول جين
2. GC، GC3s وموقف كودون معين G + C
3. ثنائي النوكليوتيد التكوين (في جميع الأطر كودون ثلاثة)
4. استخدام حمض أميني
5. النسبي استخدام الأحماض الأمينية
6. تسلسل معلومات النظام الجيني الاستخدام
7. النسبي استخدام كودون مرادف
· يمكن يترجم المفهوم تسلسل البروتين
· تنسيقه تسلسل البيانات
· الإنسان أو آلة الانتاج قراءة
· يمكن لسلسلة الجينات (مع المحافظة على إطار القراءة) لحساب
1. استخدام كودون العام
2. محتوى GC
3. تكوين ثنائي النوكليوتيد
يولد جداول كودون، الأحماض الأمينية، أو استخدام RSCU
· حتى يمكن أن تساعدك على معرفة الشفرة الوراثية.
· وأكثر من ذلك
البحث حسب الفئة
- أدوات المطورين
- ألعاب
- البرامج الأمنية
- البرامج السمعية
- البرمجيات وتطوير الشبكة
- السائقين
- العمل والمكتب البرمجيات
- القرص وملف البرنامج
- المتصفحات
- المنزل والأسرة البرمجيات
- برامج الإنتاجية
- برامج الاتصالات
- برامج الفيديو
- برمجيات الإنترنت
- برمجيات التصميم الجرافيكي
- برمجيات الشبكات
- برنامج الصور الرقمية
- تحسينات سطح المكتب
- تربية والعلوم البرمجيات
- أتمتة التصميم الإلكتروني
- أدوات التدريس
- أدوات الطلابية
- الآلات الحاسبة العلمية
- الإضافات عيار
- البرمجيات العلوم
- البرنامج الديني
- الصحة واللياقة البدنية البرمجيات
- الفيزياء والكيمياء البرمجيات
- الكتاب الإلكتروني البرمجيات
- اللغات الأجنبية البرمجيات
- المحولات وحدة
- المعلوماتية الحيوية
- برنامج الأنساب
- برنامج الجغرافيا
- برنامج الذكاء الاصطناعي
- برنامج الرياضيات
- برنامج علم الفلك
- قواميس ومترجمين
- المزيد من البرمجيات التعليمية والعلمية
- على الشاشة
- نظام المرافق
البرامج الشعبية
-
Java Algebra System 17 Feb 15
-
CLC Sequence Viewer 2 Jun 15
-
gEDA 17 Feb 15
-
Maitreya's Dream 11 May 15
-
Nightshade 14 Apr 15
-
ngspice 17 Feb 15
-
XEphem 11 May 15
CodonW
برامج مماثلة
البرامج الأخرى من المطور John Peden
WP BackItUp
1 Oct 15
تعليقات ل CodonW
البحث حسب الفئة
- أدوات المطورين
- ألعاب
- البرامج الأمنية
- البرامج السمعية
- البرمجيات وتطوير الشبكة
- السائقين
- العمل والمكتب البرمجيات
- القرص وملف البرنامج
- المتصفحات
- المنزل والأسرة البرمجيات
- برامج الإنتاجية
- برامج الاتصالات
- برامج الفيديو
- برمجيات الإنترنت
- برمجيات التصميم الجرافيكي
- برمجيات الشبكات
- برنامج الصور الرقمية
- تحسينات سطح المكتب
- تربية والعلوم البرمجيات
- أتمتة التصميم الإلكتروني
- أدوات التدريس
- أدوات الطلابية
- الآلات الحاسبة العلمية
- الإضافات عيار
- البرمجيات العلوم
- البرنامج الديني
- الصحة واللياقة البدنية البرمجيات
- الفيزياء والكيمياء البرمجيات
- الكتاب الإلكتروني البرمجيات
- اللغات الأجنبية البرمجيات
- المحولات وحدة
- المعلوماتية الحيوية
- برنامج الأنساب
- برنامج الجغرافيا
- برنامج الذكاء الاصطناعي
- برنامج الرياضيات
- برنامج علم الفلك
- قواميس ومترجمين
- المزيد من البرمجيات التعليمية والعلمية
- على الشاشة
- نظام المرافق
البرامج الشعبية
-
RebeccaAIML 3 Jun 15
-
EDFbrowser 17 Feb 15
-
ngspice 17 Feb 15
-
XEphem 11 May 15
-
OpenGTS 11 May 15
-
MeVisLab 3 Jun 15
-
iqr 14 Apr 15
لم يتم العثور على التعليقات