Bioinformatics Benchmark System

البرمجيات قطة:
Bioinformatics Benchmark System
تفاصيل البرنامج:
الإصدار: 3
تاريخ إيداع: 3 Jun 15
المطور: Joe Landman
ترخيص: حرر
شعبية: 8

Rating: 4.0/5 (Total Votes: 1)

نظام المعيار المعلوماتية الحيوية هو محاولة لبناء إطار معقول الاختبار، والاختبارات، والبيانات، لتمكين المستخدمين النهائيين والموردين للتحقيق في أداء أنظمتها.
ما نحاول القيام به هو خلق إطار للاختبار، ومجموعة أساسية من الاختبارات يتمكن الجميع من تحميل واستخدامها لتحقيق عناصر محددة من أداء النظم.
وعلاوة على ذلك، هي مصدر لهذه الاختبارات المتاحة تحت GPL، ويتم استضافتها على Bioinformatics.org وقابلة للمعلوماتية LLC والفكرة هي لتمكين المستخدمين النهائيين والمستهلكين والمطورين النظم، وغيرهم بسهولة لبناء واستخدام اختبارات ذات مغزى لأسباب قياس وضبط .
جو لاندمان من تحجيم المعلوماتية LLC تصور فكرة وكتب رموز الأصلية. نحن نبحث عن اقتراحات إضافية القياسي رمز والاختبارات ومجموعات البيانات، الخ
الاختبارات الأساسية الحالية هي تدير عدة NCBI BLAST، عدة أشواط HMMer، ومجموعة متنوعة من غيرها. ونحن نخطط لتشمل ClustalW، جنبا إلى جنب X! والكيمياء المختلفة، وديناميات، والاختبارات ذات الصلة، فضلا عن العديد من الآخرين.
اختبارات مثل LINPACK أو HPL ببساطة لا توفر مؤشرات الأداء ذات مغزى أو النماذج التنبؤية للمعلوماتية عالية الأداء. للأسف، ولا القيام بعدد من أكثر التجارب الأخيرة ومركزة.
هذا هو المشكلة كما LINPACK وHPL اختبار تحديدا في الأداء على مختلف العمليات المصفوفة، حيث لديك أنماط الوصول إلى الذاكرة العادية على نحو فعال، وعمليات حسابية محددة.
هذه الرموز هي الأكثر فائدة للمقارنة إلى الرموز مع عملية نقطة عائمة الثقيلة، وحركة المرور الذاكرة معشق. لم تصمم هذه الرموز لقياس النظم الشامل، حيث القرص I / O، الكمون الذاكرة، وعوامل أخرى تسهم جميعها في مشكلات في الأداء.
أفضل الاختبارات هي تلك التي هي على غرار معظم الرموز التي سوف تعمل على الجهاز. الاختبارات أنفسهم يجب أن تكون تقريبية معقولة لتنفيذ حقيقي من التعليمات البرمجية الخاصة بك، وذلك باستخدام بيانات حقيقية. قد تحتاج لحلج مرة أخرى من أجل الحصول الأوقات المدى واقعية.
يجب أن يكون لديك مجموعة فرعية معقولة من أحجام البيانات. وهناك اختبار واحد لا اقول لكم كيف موازين النظام الخاص بك، وأحد أسباب الوجود من هذا الاختبار هو خصيصا للسماح لك لاختبار الأداء أثناء زيادة جوانب مختلفة من عبء العمل.
نادرا ما تحصل على نظام هادئة في كتلة، لذلك فإننا نوصي بأن محاولة تشغيل في واقعية كما تشكل بيئة التشغيل ممكن. خط الأساس في نظام هادئة على ما يرام، ولكن يجوز لها أن تحدد توقعاتك بشكل غير معقول.
أعلى

برامج مماثلة

AHREA
AHREA

11 May 15

PathVisio
PathVisio

18 Feb 15

tapir
tapir

11 May 15

تعليقات ل Bioinformatics Benchmark System

لم يتم العثور على التعليقات
إضافة تعليق
بدوره على الصور!