CLC Main Workbench

البرمجيات قطة:
CLC Main Workbench
تفاصيل البرنامج:
الإصدار: 7.7.3 محدث
تاريخ إيداع: 11 Nov 16
المطور: CLC bio
ترخيص: تجاري
السعر: 0.00 $
شعبية: 342
حجم: 185186 Kb

Rating: 2.0/5 (Total Votes: 5)

وهذا العرض الوظيفي لمدة 4 أسابيع تماما من CLC المشتركة طاولة العمل المجاميع كل تسلسل الحمض النووي تحليلات CLC جين طاولة العمل وجميع بروتين تسلسل تحليلات طاولة العمل البروتين مجالس الصحوة. يتم دمج جميع التحليلات بشكل كامل في واحد، وسهلة الاستخدام، وبديهية تطبيق برنامج واحد <ص> ما هو الجديد في هذا الإصدار:

ImprovementsUpdated قائمة انزيم التقييد من REBASE على & nbsp؛ علة fixesFixed مشكلة مع. تشغيل انفجار على وصلات ماك Sierra.Updated PFAM على & nbsp؛ ذكرت والبحث المجال PFAM tool.Fixed قضية أدخلت في ونبسب؛ CLC الرئيسية طاولة العمل 7.7.2 حيث الإنزيمات المذكورة أبجديا بعد كانت RdeGBI المفقودين مثيلة informationVarious بوجفيكسيس طفيفة

. ما هو الجديد في الإصدار 7.7.2:

وسير العمل

ويمكن الآن أن يتم تكوين مخرجات العمل بحيث المجلدات الفرعية لاحتواء يتم إنشاء المخرجات.
هي النائبة الجديدة المتاحة عند تحديد أسماء مخرجات العمل: {المستخدم}، {المضيف}، وعناصر من الطابع الزمني للكائن الإخراج، {العام}، {شهر}، {يوم}، {ساعة}، {دقيقة} ، {ثانيا}.
النائبة ضمن أسماء الإخراج سير العمل التي كانت متاحة سابقا فقط كما يمكن الآن أن تحدد الأرقام باستخدام أسماء مكتوبة: {اسم} هو مرادف ل{1} و {إدخال} هي مرادفات ل{2}.

<فئة ف = "_ mce_tagged_br"> عند استخدام {2} نائبا لتسمية مخصصة في عناصر الانتاج سير العمل، وسوف تدرج فقط المدخلات مقفلة باسم ولدت.




<فئة ف = "_ mce_tagged_br"> في قوات الدفاع الشعبي ولدت تظهر جميع المعلمات تكوين لسير العمل، إدخالات المعلمات إتصال إلى أداة أو عنصر إدخال قائمة الآن أسماء عناصر حاسمة. سابقا تركت قوائم المعلمة لمثل هذه العناصر فارغة.




<فئة ف = "_ mce_tagged_br"> أين تم تغيير اسم الأداة في العمل، والآن تضمين اسم الأصلي جنبا إلى جنب مع تغيير الاسم عند تصدير المعلمات سير العمل.



وجهة نظر التاريخ من عناصر البيانات التي تم إنشاؤها باستخدام سير العمل يتضمن معلومات عن سير العمل الذي خلقهم.



ترتيب الأدوات في سير العمل "إضافة عنصر" القائمة الآن مباريات النظام في القائمة أدوات طاولة العمل.
تحسين التحقق من صحة سير العمل لمساعدة المستخدم في تحديد المدخلات التي سيتم تجاهلها نظرا لتكوين عناصر العمل.

& نبسب؛


إطلاق

& نبسب؛



والآن وجدت الأداة التشغيل السريع ضمن القائمة أدوات بدلا من القائمة عرض وزر يسمى إطلاق إحضار هذه الأداة قد أضيفت إلى شريط الأدوات.

ويمكن الآن بدأت التحليلات على عناصر البيانات المدرجة في الجدول نتائج البحث المحلي من خلال اختيار العناصر من الفائدة، والنقر على الحق مع الماوس والتنقل من خلال قائمة السياق التي تظهر.



& نبسب؛


البيانات الوصفية

& نبسب؛


على & nbsp؛ A & نبسب؛ "إزالة جمعية (ق)" تم إضافة خيار لإزالة جمعيات الفوقية من عناصر البيانات المحددة الخطيئة وجهة الفوقية عناصر في اليمين في سياق انقر فوق القائمة.

في البيانات الوصفية البحث عن البيانات المرتبطة مشاهدته الآن أيضا من الممكن استخدام البحث في منطقة التنقل عندما يتم اختيار عدة صفوف.



عند استيراد بيانات التعريف من جدول بيانات مع الصيغ في ذلك، والآن المستوردة نتيجة تقييم الصيغة (كما هو معروض في Excel) بدلا من الصيغة نفسها.

& نبسب؛


جنرال لواء

ويتم تشفير الآن كل اتصال الملقم NCBI. (NCBI سيتم نقل جميع خدمات شبكة الإنترنت لبروتوكول HTTPS في 30 سبتمبر 2016) على & nbsp؛



قائمة الأنزيمات المثبتة مسبقا في طاولة العمل ونبسب؛ تم تحديثها من REBASE



والخيار "غير موجود في قائمة" تم تقديمه على أنه خيار جديد تصفية الجدول.




وترد <ص> اقرأ تفاصيل المجموعة الآن على عرض معلومات عنصر من قوائم تسلسل.



وبنك الجينات استيراد الآن أيضا يسمح لأسماء الملفات مع التمديد "GBFF".



و"فرز مجلد" يستخدم أداة الآن الفرز العددي لأسماء مسبوقة برقم.


تتوفر النائبة الجديدة عند تحديد أسماء النواتج مصدر: & نبسب؛ {المستخدم} & nbsp؛ و{المضيف}، وعناصر من الطابع الزمني للكائن الإخراج، {العام} & nbsp؛ و{شهر} & nbsp؛ و{اليوم} & nbsp؛ و{ساعة & nbsp؛ و{دقيقة} & nbsp؛ و . {الثانية} على & nbsp؛
النائبة ضمن أسماء الإخراج التصدير التي كانت متاحة سابقا فقط كما يمكن الآن أن تحدد الأرقام باستخدام أسماء مكتوبة: {إدخال} مرادف ل{1}، {تمديد} مرادف ل{2} و {مكافحة} مرادف ل{ (3)}.

ما هو الجديد في النسخة 7.7.1:



قضية الثابتة التي نشأت عند تنفيذ سير العمل مع مدخلات متعددة دفعة واحدة، حيث تغييرات محددة مسبقا، لم تطبق المدخلات ثابتة محددة خلال عملية الاطلاق.
قضية الثابتة حيث الأداة الحافز البحث أبلغ عن دقتها مباراة إما 0٪ أو 100٪ بشكل غير صحيح.
قضية الثابتة حيث فرز مجلد في حين الادخار نحو ذلك قد يؤدي خطأ.
إصلاح الخلل في الحوار دفعة واسطة من شأنها أن تؤدي إلى خطأ عندما ووجهت المشاكل المتعلقة الملف أو بيانات الموقع الأساسي.

ما هو الجديد في النسخة 7.7:

واستيراد الفوقية - الأساسية واستيراد من السهل الفوقية. هذه الأداة تكمل الأدوات المتاحة في الجدول محرر البيانات الوصفية.

ما هو الجديد في النسخة 7.6.4:

إصلاح الأخطاء

إصلاح الخلل عند البحث عن تسلسل في أداة الأهلي قد تفشل في تحميل تسلسل النوكليوتيدات مع رسالة الخطأ "لم تكن تحميل تسلسل التالية بشكل صحيح.
إصلاح مشكلة في انفجار في NCBI خطوة إنشاء البروتين أداة التقرير.
قضية الثابتة مما يؤدي إلى وجود خطأ أثناء التصدير VCF حيث كانت البيانات المعنية قد تم استيرادها أصلا من ملفات VCF والقيم في الحقل QUAL الأعداد الصحيحة ونبسب؛
تصدير أرقام (عشري) الفاصلة العائمة إلى VCF & نبسب؛ وشكل تعتمد سابقا على اللغة المحددة. تم إصلاح هذا بحيث تطبيق & nbsp؛ الفاصل العشري على & nbsp؛ الآن دائما هو نقطة.
عند القيام جمعية التلقائي من الفوقية، ويظهر سجل الآن وبيانات التعريف والصفوف التي لا ترتبط مع أي بيانات.
إصلاح الخلل التي حالت دون معلومات اليدوية الوصفية يمكن الوصول إليها من داخل منضدة.
إصلاح الخلل حيث تقوم جمعية التلقائي باستخدام جدول بيانات التعريف المخزنة على خادم CLC ستبوء بالفشل.
جمعية تلقائية من البيانات الوصفية الآن يعالج جمعية بناء على بادئة أسماء البيانات نوعا ما، وعلى وجه الدقة مطابقة لاسم بيانات كاملة.

وجدول الفوقية لم يعد يحتاج عمود أساسي لصفوف لتترافق يدويا مع عناصر البيانات.
تمت إزالة خيار لتجاوز الأدوار الفوقية مرئية مسبقا في تكوين النواتج سير العمل.
إصلاح خطأ يحدث عندما بيانات الموقع طاولة العمل كان لافتا في ملف على النظام بدلا من مجلد. وسوف تظهر الآن غير متوفرة كما هو الحال في منطقة طاولة العمل للملاحة.
تلميحات تمكين جميع المعلمات عند تكوين وتنفيذ سير العمل.
يجب أن عملية تسجيل الدخول من طاولة العمل إلى خادم CLC الآن إكمال قبل فتح رابط CLC سوف تبدأ.
إصلاح المشكلة على أجهزة ماكينتوش حيث لم يتم التعرف على طاولة العمل كما معالج بروتوكول مخصص لCLC: // عناوين المواقع.
حل استثناء تحدث نادر يمكن أن يكون سببها التحول رأي محرر بنقرة مزدوجة.

ما هو الجديد في النسخة 7.6.3:

والميزات الجديدة والتحسينات


التجميع على العناصر المحددة هي الآن ممكنة: كان عليه أن يقتصر على المجلدات المحددة.
يمكن للمرء الآن اختيار "EST" كما قاعدة البيانات عند استخدام البحث لتسلسل في أداة NCBI.
التسلسل الهرمي للمجموعات أداة عينات يمكن الآن يتم تنفيذها كجزء من سير العمل وعلى الخادم.
إدارة محسنة للذاكرة عند التعامل مع عناصر التقرير كبيرة.
تلميحات على أوراق الأشجار النشوء والتطور الآن عرض وصفا للتسلسل المرفقة.
لم يعد يتم إلحاق الأرقام إلى أسماء العناصر سير العمل عند إنشاء نسخة من سير العمل باستخدام "فتح نسخة من سير العمل".
إدارة البيانات الوصفية. تتبع ملفات الإدخال واستيراد المعلومات الوصفية لالعينات الخاصة بك.

وإصلاحات الشوائب

إصلاح مشكلة تحدث نادرة حيث منضدة سوف يعرض رسالة خطأ عند تثبيت البرنامج المساعد المرخص 3rd الطرف.
قضية الثابتة حيث اختيار إدخال في جدول النتائج انفجار يمكن تسليط الضوء على محاذاة خاطئة في محرر انفجار إذا كان قد تم تصفيتها الجدول أو فرزها.
قضية الثابتة حيث النقر على تعليق توضيحي في محرر الاشعال التصميم يمكن أن تؤدي إلى رسالة خطأ.
قضية الثابتة حيث الشروح التي امتدت نهايات سلسلة دائرية سيتم وضعها بشكل غير صحيح في تسلسل عرض التعميم.
إصلاح الخلل الذي تسبب في طاولة العمل لتجميد إذا تم عرض بعض متواليات في ضوء دائرية مع تقديم شعاعي من التسميات.
تقارير صدرت الثابتة وجود مؤلف الخطأ في بعض الحالات.
قضية الثابتة حيث إنشاء مربع قطعة أرض ويمكن تشغيل مدير تحليل مكون أحيانا بحجج غير قانونية، مما يؤدي إلى رسالة خطأ.
إخراج أداة عكسي يكمل تسلسل يحصل الآن -RC احقة تعلق على اسم المدخل بدلا من -1 قبل.
إصلاح الخلل في أداة هيكل الثانوي التنبؤ عندما تم اختيار الخيار لحساب دالة قسم لجزيئات طويلة (& GT، 1000 النيوكليوتيدات).

وقضية الثابتة حيث واحد لا يمكن تكبير بعد التصغير بشكل كامل على سير العمل كبيرة جدا.
قضية الثابتة التي حالت دون مجلد الجذر على محركات الأقراص ويندوز من أن تستخدم بمثابة موقع ملف.
قضية الثابتة حيث استكمال تثبيت موجود على ويندوز من شأنه أن يؤدي في ملف .vmoptions يتم حذفها، مما يجعل منضدة تشغيل مع التكوين جافا الافتراضية.

ما هو الجديد في النسخة 7.6.2:

علة المآزق

أضافت عمل حول قضية جافا التي أدت في بعض الأحيان في منضدة عرض خطأ غير المفيدة والتي تتطلب إعادة تشغيل لمواصلة العمل.
قضية الثابتة مع تشغيل انفجار في NCBI فيها خطأ ولدت NCBI-حول الحد من استخدام وحدة المعالجة المركزية التي تجاوزت لم يتم الإبلاغ بها بصورة شفافة وتناقلتها وسائل الإعلام نتيجة ل"لا يضرب" بدلا من ذلك.
تم تطبيق الإصلاح لتجنب استثناء في الظروف عندما فشل تنظيف الملفات التي تم تحميلها من انفجار.
على عكس أداة ترجمة تجاهلت أي الشفرة الوراثية المحددة في الجداول التكرارية كودون. وبالتالي فإن كل الترجمة العكسية الافتراضي إلى الشفرة الجينية القياسية.
عند تثبيت سير العمل مع البيانات المجمعة، فإنه لم يعد من الممكن لتحديد مجلد للقراءة فقط لتخزين البيانات.
ثابت عرض الخطأ من "تنسيق معتمد" عند تصدير عناصر من أي محرر المجلد أو محرر البحث المحلي.
الإصلاح من ملف خطأ محتمل يتم حفظ عند تحرير ملف وجدت عن طريق محرر البحث المحلي.
وتظهر الآن المؤامرات داخل التقارير مع إعدادات لوحة الجانب المحفوظة لديه.
الثابتة توفير ألوان الخطوط المختلفة في المؤامرات من خلال لوحة جانبية.تمكين

وخيار لوحة جانبية لإظهار الأساطير عن مؤامرة مع أكثر من 10 عينات الآن.
قضية الثابتة التي أدت إلى خطأ عند تقديم مؤامرات لمجموعات البيانات فارغة.
قضية الثابتة حيث كان الخيار "إفراغ سلة المحذوفات" في بعض الأحيان غير متوفرة بشكل غير صحيح.

ما هو الجديد في النسخة 7.6.1:


الميزات الجديدة والتحسينات

المصدر GTF متاح للطاولة العمل الرئيسي الآن.
Transcriptomics التجربة والجداول عينة يمكن الآن فرزها، حتى مع أعداد كبيرة من الصفوف.
تحسين اكسل، HTML وعلامة التبويب تصدير المتغيرات (اختر فقط الشروح / الأعمدة التي تحتاج إليها).

إصلاح الأخطاء

إصلاح خطأ يؤثر على "/ بعد اختيار قطع تسلسل قبل" أداة في محرر الاستنساخ.
وفسر علة ثابتة حيث يسار مزدوجا فوق سرعان ما تبع ذلك النقر بزر الماوس الأيمن كما انقر نقرا مزدوجا على OS X (في قائمة نتائج البحث المثابرة، في شجرة الأدوات، وفي محرر سير العمل).

ما هو الجديد في النسخة 7.6:

الميزات الجديدة والتحسينات

مسارات:

خرج متسقة عندما إثراء المسارات البديل والمسارات الشرح مع أعمدة الجدول اضافية. الناتج المسارات من هذه الأدوات والآن لدينا نفس العدد من أعمدة الجدول أضاف وسوف الأعمدة يكون دائما في نفس الترتيب. سابقا، إذا كان عمود أضاف قيم فارغة لكافة الصفوف البديل، لكان قد تم إزالتها من الجدول النهائي، مما أسفر عن عدد والنظام النسبي من أعمدة إضافية عندما تم تجهيز عينات متعددة مع نفس الأدوات / سير العمل متفاوتة. يتم الاحتفاظ كافة الأعمدة الآن، وتسهيل التجهيز النهائي من الجداول تصدير، وتوفير مرجعية بصرية فورية على النحو الذي تم تطبيق أدوات تخصيب / الشرح، حتى لو لم تسفر عن أي نتائج عينة معينة.
جداول المسارات البديل والمسارات الشرح يمكن الآن فرز وأعمدة فلتر مع الخلايا التي تحتوي على أرقام متعددة.
تحسين المشاهد المسار لالبديل المسارات لإظهار تسلسل تغيير على البديل المقدمة.
تظهر مسارات الرسم البياني الآن القيم السلبية شغل صعودا إلى y = 0 (كما هو متوقع).

وزيادة العشرية للأرقام عند تصدير الجدول إلى CSV، علامة التبويب نص محدد، وإكسل.
تحسين الإبلاغ عن الأخطاء المتعلقة انخفاض مساحة القرص.


ما هو الجديد في النسخة 7.5.1:



أصبح من الممكن الآن لتشغيل سير العمل دون إدخال اختياري.
لم الأداة AAC لا الحواشي المتغيرات في 3 'UTR مع تغير مستوى الحمض النووي باستخدام تنسيق وHGVS c.xxx. وهذا يؤثر على أي تحليل ذلك مع جي إكس 7.5 أو في وقت سابق يستند CDS المسارات ENSEMBL من versons كبار السن. يجب إعادة بنائه تحليل AAC باستخدام جي إكس 7.5.1 الشرح الصحيح.
PFAM علة تصفية ثابتة. في وقت سابق، ذكرت PFAM فقط المجال الأول من كل نوع في استعلام ونتيجة لذلك كان غاب عن العديد من المجالات. من المستحسن أن المستخدمين الذين البحث يعتمد على الشروح PFAM إعادة تشغيل الأداة على البيانات الخاصة بهم.
إصلاح الخلل في 'إمكانية قصوى التأريخ العرقي "أداة التي فشلت عندما توليد القيم التمهيد لبعض التحالفات الإدخال.
المشكلة الثابتة مع التمرير إلى الملفات ذات الصلة عند اختيار الأشياء كمعلمات في المعالجات الأداة.
وقد تحسنت نتائج نص انفجار بحيث تظهر الاستعلام الصحيح والمواقف الخاضعة بغض النظر عن حبلا.
إصلاح المشكلة التي حالت دون عمليات انفجار عند اختيار لتشغيل هذه على ملقم مجالس الصحوة.
أصبح من الممكن الآن لتشغيل سير العمل دون إدخال اختياري.

برامج مماثلة

MathTools
MathTools

18 Jan 18

Cartographica
Cartographica

5 May 20

PosterGenius
PosterGenius

23 Nov 14

Plot
Plot

22 Nov 14

البرامج الأخرى من المطور CLC bio

تعليقات ل CLC Main Workbench

لم يتم العثور على التعليقات
إضافة تعليق
بدوره على الصور!